More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2799 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
566 aa  1115    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.11 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.02 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.98 
 
 
571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.93 
 
 
501 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.87 
 
 
502 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.02 
 
 
854 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.29 
 
 
449 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.98 
 
 
741 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.72 
 
 
462 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.63 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.3 
 
 
544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.76 
 
 
530 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.04 
 
 
474 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.49 
 
 
508 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.31 
 
 
635 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.26 
 
 
573 aa  362  8e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.8 
 
 
631 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.24 
 
 
443 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.06 
 
 
491 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  46.08 
 
 
607 aa  357  5e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  39.17 
 
 
728 aa  356  6.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.52 
 
 
503 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.88 
 
 
392 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.69 
 
 
453 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.95 
 
 
456 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.94 
 
 
507 aa  349  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.79 
 
 
468 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.3 
 
 
476 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.58 
 
 
444 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.58 
 
 
444 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.58 
 
 
444 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.43 
 
 
590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.64 
 
 
512 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.39 
 
 
446 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
467 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.57 
 
 
636 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.68 
 
 
498 aa  339  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.73 
 
 
551 aa  334  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.31 
 
 
491 aa  333  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.58 
 
 
507 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.66 
 
 
463 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.32 
 
 
467 aa  290  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  43.32 
 
 
527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.17 
 
 
489 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.76 
 
 
480 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
463 aa  287  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.96 
 
 
482 aa  287  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
509 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.7 
 
 
628 aa  286  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
520 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  42.78 
 
 
520 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
520 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 
511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  41.05 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.45 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  50.49 
 
 
374 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.9 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.93 
 
 
513 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.5 
 
 
535 aa  282  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.44 
 
 
559 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.43 
 
 
550 aa  283  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.74 
 
 
494 aa  282  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.29 
 
 
581 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.45 
 
 
445 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  43.97 
 
 
469 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
511 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.09 
 
 
480 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.93 
 
 
479 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
497 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.62 
 
 
482 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  42.62 
 
 
482 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  42.62 
 
 
482 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
525 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.62 
 
 
482 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  37.04 
 
 
460 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  42.62 
 
 
482 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  42.62 
 
 
481 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  40.22 
 
 
622 aa  280  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.14 
 
 
479 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.8 
 
 
506 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.32 
 
 
515 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.71 
 
 
629 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  33.02 
 
 
495 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
498 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.32 
 
 
525 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.32 
 
 
526 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.16 
 
 
545 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  36.88 
 
 
635 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  37.58 
 
 
491 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.9 
 
 
549 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.41 
 
 
559 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.41 
 
 
578 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  42.35 
 
 
484 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.27 
 
 
626 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  42.29 
 
 
574 aa  276  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  38.41 
 
 
482 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  39.94 
 
 
639 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.71 
 
 
471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  43.34 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>