More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1460 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
491 aa  969    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.41 
 
 
476 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.48 
 
 
444 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  65.48 
 
 
444 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.48 
 
 
444 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.03 
 
 
468 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.39 
 
 
635 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.57 
 
 
631 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.18 
 
 
443 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.75 
 
 
512 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.84 
 
 
503 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.75 
 
 
530 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.05 
 
 
636 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.27 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.04 
 
 
392 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.71 
 
 
551 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.09 
 
 
456 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  53.45 
 
 
728 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.71 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  55.1 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.66 
 
 
498 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.83 
 
 
453 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.28 
 
 
507 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.09 
 
 
467 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.99 
 
 
491 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.36 
 
 
571 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.92 
 
 
741 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.9 
 
 
469 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.86 
 
 
502 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 
461 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.95 
 
 
501 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.31 
 
 
462 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.6 
 
 
449 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.76 
 
 
489 aa  359  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.87 
 
 
590 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.61 
 
 
854 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.52 
 
 
508 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.32 
 
 
544 aa  340  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.48 
 
 
566 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.9 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.44 
 
 
507 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  46.13 
 
 
374 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
448 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  42.2 
 
 
629 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.2 
 
 
629 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.33 
 
 
628 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.34 
 
 
499 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.74 
 
 
443 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  42.47 
 
 
622 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.01 
 
 
497 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.05 
 
 
565 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  41.06 
 
 
445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 
455 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  39.47 
 
 
418 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.31 
 
 
462 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.37 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.37 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.37 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.37 
 
 
453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.37 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.4 
 
 
459 aa  270  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.91 
 
 
627 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.15 
 
 
463 aa  269  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.21 
 
 
429 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.19 
 
 
454 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  35.48 
 
 
424 aa  269  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.19 
 
 
454 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  41.19 
 
 
454 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
454 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.19 
 
 
454 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.19 
 
 
455 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.3 
 
 
418 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.72 
 
 
418 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  41.19 
 
 
454 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.19 
 
 
454 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.38 
 
 
480 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 
626 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.9 
 
 
626 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  37.88 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.67 
 
 
571 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.58 
 
 
513 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.94 
 
 
476 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.92 
 
 
454 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  37.83 
 
 
540 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  36.71 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.39 
 
 
467 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.4 
 
 
630 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.42 
 
 
550 aa  266  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  39.95 
 
 
559 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.27 
 
 
495 aa  266  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.95 
 
 
482 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  39.95 
 
 
482 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.64 
 
 
452 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  39.95 
 
 
481 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  39.95 
 
 
482 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  39.95 
 
 
482 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.95 
 
 
482 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.49 
 
 
509 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>