More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2437 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  89.49 
 
 
468 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.91 
 
 
444 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  73.91 
 
 
444 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.91 
 
 
444 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.11 
 
 
476 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.33 
 
 
635 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.63 
 
 
503 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.93 
 
 
631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.13 
 
 
636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.18 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  64.9 
 
 
512 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.27 
 
 
474 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.19 
 
 
530 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.5 
 
 
456 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.86 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.32 
 
 
551 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.5 
 
 
573 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.04 
 
 
507 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.65 
 
 
498 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  55.72 
 
 
728 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.96 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.89 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  52.37 
 
 
607 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.61 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.01 
 
 
571 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.49 
 
 
741 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.19 
 
 
502 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.52 
 
 
489 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.12 
 
 
462 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.51 
 
 
501 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.46 
 
 
449 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.86 
 
 
854 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.54 
 
 
461 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.82 
 
 
469 aa  362  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
544 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.26 
 
 
508 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.78 
 
 
590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.19 
 
 
566 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.71 
 
 
507 aa  328  8e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.64 
 
 
446 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.42 
 
 
448 aa  309  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.44 
 
 
426 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  42.57 
 
 
398 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.62 
 
 
582 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
423 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.17 
 
 
499 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.07 
 
 
561 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
526 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.87 
 
 
515 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
525 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
525 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.98 
 
 
485 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.6 
 
 
618 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.79 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.51 
 
 
423 aa  272  7e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  50 
 
 
374 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.81 
 
 
499 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  45.56 
 
 
649 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.49 
 
 
503 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  44.6 
 
 
697 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.5 
 
 
429 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
494 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.48 
 
 
611 aa  270  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.32 
 
 
477 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.05 
 
 
550 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.82 
 
 
593 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.06 
 
 
467 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.64 
 
 
452 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  38.89 
 
 
424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.42 
 
 
567 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.26 
 
 
598 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.68 
 
 
460 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.44 
 
 
544 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  41.6 
 
 
446 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.43 
 
 
580 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.17 
 
 
506 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.7 
 
 
506 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37 
 
 
491 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.38 
 
 
580 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.7 
 
 
535 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.55 
 
 
480 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  44.32 
 
 
393 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.94 
 
 
565 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 
514 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.48 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  42.01 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  42.01 
 
 
485 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.01 
 
 
485 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  42.01 
 
 
485 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.8 
 
 
479 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  39.26 
 
 
445 aa  263  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  42.01 
 
 
485 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.46 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  38.65 
 
 
484 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.27 
 
 
454 aa  262  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 
557 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  40.27 
 
 
454 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.27 
 
 
454 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>