More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2450 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 508 aa  1034    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.42 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.98 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.17 
 
 		 657 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.98 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.65 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  42.94 
 
 		 543 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.21 
 
 		 522 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  42.32 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.35 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.08 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.17 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.64 
 
 		 455 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.08 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.08 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  46.08 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.08 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.6 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 		 525 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.21 
 
 		 578 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.52 
 
 		 450 aa  346  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.6 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.28 
 
 		 436 aa  346  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 		 526 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.69 
 
 		 560 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.23 
 
 		 485 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.27 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.42 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.28 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.65 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  47.76 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.23 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.23 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.73 
 
 		 488 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.49 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.8 
 
 		 549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.74 
 
 		 550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.97 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.27 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  47.76 
 
 		 486 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 		 486 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.52 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  46.21 
 
 		 540 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.98 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.99 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.38 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.77 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.18 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  46.92 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.93 
 
 		 462 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.04 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.04 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.88 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.94 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.53 
 
 		 581 aa  340  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.79 
 
 		 409 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.07 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.05 
 
 		 540 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.6 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.04 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.5 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  42.61 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.94 
 
 		 628 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.98 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.98 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.22 
 
 		 463 aa  336  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.53 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  44.42 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.97 
 
 		 567 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.39 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  47.2 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.81 
 
 		 599 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.76 
 
 		 624 aa  333  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  43.07 
 
 		 398 aa  333  5e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.76 
 
 		 496 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48 
 
 		 497 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  47.15 
 
 		 484 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.07 
 
 		 454 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  41.26 
 
 		 458 aa  332  9e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.07 
 
 		 454 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.9 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.397451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  46.07 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.07 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.07 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.07 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  46.07 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  45.31 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.55 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.22 
 
 		 448 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  42.61 
 
 		 574 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.7 
 
 		 418 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>