More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 
657 aa  1338    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.54 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  54.17 
 
 
551 aa  484  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.48 
 
 
508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.16 
 
 
414 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  43.24 
 
 
543 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.04 
 
 
476 aa  350  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
513 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.04 
 
 
477 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.84 
 
 
455 aa  347  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.01 
 
 
452 aa  346  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 
480 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 
479 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 
454 aa  346  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 
454 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  49.21 
 
 
454 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.21 
 
 
454 aa  345  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.56 
 
 
515 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 
454 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  49.21 
 
 
454 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  49.48 
 
 
484 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.34 
 
 
489 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 
455 aa  345  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.12 
 
 
578 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.34 
 
 
522 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 
486 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  49.48 
 
 
486 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.47 
 
 
549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 
486 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.46 
 
 
462 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.24 
 
 
535 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.95 
 
 
454 aa  343  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.95 
 
 
454 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.03 
 
 
456 aa  343  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.24 
 
 
415 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.34 
 
 
514 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 
549 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.17 
 
 
453 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.17 
 
 
453 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.17 
 
 
453 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.17 
 
 
453 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.17 
 
 
453 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.18 
 
 
480 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.01 
 
 
545 aa  340  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  48.78 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.18 
 
 
482 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.27 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.85 
 
 
533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.78 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  48.78 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  46.17 
 
 
491 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  48.78 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  48.78 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.4 
 
 
550 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.01 
 
 
450 aa  336  7e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  47.37 
 
 
445 aa  336  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  46.76 
 
 
574 aa  336  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.12 
 
 
494 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.23 
 
 
511 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.58 
 
 
509 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.11 
 
 
601 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.47 
 
 
624 aa  334  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.77 
 
 
599 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 
497 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.86 
 
 
482 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  47.31 
 
 
559 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.72 
 
 
473 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.04 
 
 
511 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.09 
 
 
425 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  46.4 
 
 
527 aa  333  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.09 
 
 
571 aa  333  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
525 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
525 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.04 
 
 
526 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.93 
 
 
581 aa  332  9e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.09 
 
 
482 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  48.09 
 
 
482 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.77 
 
 
451 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.09 
 
 
482 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.26 
 
 
515 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.81 
 
 
452 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.77 
 
 
451 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  48.09 
 
 
481 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  48.09 
 
 
482 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  48.09 
 
 
482 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  47.12 
 
 
446 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.39 
 
 
488 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 
520 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.13 
 
 
506 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  46.67 
 
 
520 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 
520 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.66 
 
 
497 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  43.37 
 
 
426 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.32 
 
 
492 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.4 
 
 
540 aa  330  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.04 
 
 
560 aa  330  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.38 
 
 
466 aa  329  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  39.02 
 
 
495 aa  329  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.74 
 
 
479 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.81 
 
 
418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>