More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1430 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  100 
 
 
764 aa  1565    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0770  primosomal protein N'  34.42 
 
 
736 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0747  primosomal protein N'  34.42 
 
 
736 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00195838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1579  primosomal protein N'  35.89 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.73 
 
 
790 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0276  primosomal protein N'  34.12 
 
 
742 aa  392  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.350097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  33.07 
 
 
804 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  31.72 
 
 
813 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  366  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  30.34 
 
 
831 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 
801 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  32.08 
 
 
801 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  30.32 
 
 
752 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  31.66 
 
 
801 aa  364  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  35.63 
 
 
824 aa  363  6e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  31.27 
 
 
801 aa  362  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.55 
 
 
715 aa  361  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  31.09 
 
 
801 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  30.19 
 
 
752 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  35.85 
 
 
732 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.33 
 
 
739 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  31.13 
 
 
801 aa  357  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  35.86 
 
 
731 aa  357  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.29 
 
 
739 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.29 
 
 
739 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.99 
 
 
739 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  37.84 
 
 
744 aa  353  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  31.6 
 
 
848 aa  353  8.999999999999999e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  33.45 
 
 
732 aa  353  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  29.44 
 
 
832 aa  352  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.19 
 
 
745 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  31.77 
 
 
731 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  31.32 
 
 
801 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 
738 aa  352  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  35.19 
 
 
809 aa  351  3e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.35 
 
 
739 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  35.81 
 
 
732 aa  351  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35.81 
 
 
732 aa  350  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  35.81 
 
 
732 aa  350  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  36.81 
 
 
739 aa  350  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  35.11 
 
 
804 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 
732 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.62 
 
 
732 aa  349  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  35.62 
 
 
732 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 
732 aa  349  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  30.75 
 
 
802 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  30.7 
 
 
732 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 
732 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 
732 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.12 
 
 
731 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.16 
 
 
746 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  31.59 
 
 
724 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  30.7 
 
 
732 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  31.02 
 
 
732 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  35.2 
 
 
732 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  35.2 
 
 
732 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  35.2 
 
 
732 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  35.2 
 
 
732 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  37.92 
 
 
731 aa  347  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  31.39 
 
 
802 aa  346  8e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  34.02 
 
 
781 aa  345  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  28.4 
 
 
814 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  36.76 
 
 
739 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  33.83 
 
 
724 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  32.5 
 
 
825 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  35.05 
 
 
731 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  36.76 
 
 
739 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  35.01 
 
 
732 aa  344  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.23 
 
 
802 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.23 
 
 
802 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  29.92 
 
 
733 aa  343  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 
817 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  30.81 
 
 
732 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  33.45 
 
 
815 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  30.38 
 
 
815 aa  341  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  29.93 
 
 
733 aa  342  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  34.04 
 
 
733 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  30.77 
 
 
798 aa  341  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  34.72 
 
 
743 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  35.57 
 
 
662 aa  341  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  35.57 
 
 
662 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  35.03 
 
 
803 aa  341  4e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  30.19 
 
 
849 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  30.4 
 
 
914 aa  336  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  29.36 
 
 
736 aa  336  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  33.77 
 
 
775 aa  336  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  32.75 
 
 
749 aa  336  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  33.84 
 
 
732 aa  335  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  29.06 
 
 
806 aa  334  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  30.77 
 
 
836 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  33.95 
 
 
732 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.21 
 
 
754 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.16 
 
 
811 aa  333  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  35.07 
 
 
734 aa  333  8e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  32.84 
 
 
720 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  32.84 
 
 
720 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>