285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK4887 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  91.98 
 
 		 449 aa  835    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  97.56 
 
 		 451 aa  912    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  98.66 
 
 		 449 aa  919    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  100 
 
 		 451 aa  929    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  92.43 
 
 		 449 aa  849    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  82.89 
 
 		 450 aa  773    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  97.55 
 
 		 449 aa  907    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  71.3 
 
 		 449 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  86.9 
 
 		 374 aa  678    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  97.77 
 
 		 449 aa  908    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  88.24 
 
 		 374 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  57.69 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  53.49 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  37.68 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  39.51 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  37.84 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  38.15 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  37.75 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  36.45 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.91 
 
 		 623 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  35.19 
 
 		 387 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.16 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.44 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.44 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  23.84 
 
 		 1158 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  23.84 
 
 		 1168 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  25.63 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  23.53 
 
 		 1158 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.82 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  21.94 
 
 		 754 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  23.31 
 
 		 730 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  23.01 
 
 		 1121 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 		 1177 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.41 
 
 		 1169 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  25.08 
 
 		 1211 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0871  excinuclease ABC subunit B  33.6 
 
 		 658 aa  53.5  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  26.37 
 
 		 731 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 		 1109 aa  53.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  21.45 
 
 		 753 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1202 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  25.45 
 
 		 801 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  23.13 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.89 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  27.04 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  23.08 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  24.25 
 
 		 1192 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.54 
 
 		 712 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  22.52 
 
 		 1153 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.29 
 
 		 938 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  23.41 
 
 		 1167 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.75 
 
 		 1167 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  23.95 
 
 		 1192 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  23.7 
 
 		 725 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  25 
 
 		 813 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  23.73 
 
 		 768 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  25.73 
 
 		 730 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1169 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  26 
 
 		 765 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  24.77 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.08 
 
 		 805 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 		 725 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  23.58 
 
 		 832 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 		 725 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  27.01 
 
 		 736 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 		 733 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  20 
 
 		 673 aa  50.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1178 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  24.61 
 
 		 1059 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  25.91 
 
 		 732 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  24.61 
 
 		 1224 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  23.96 
 
 		 736 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  27.41 
 
 		 727 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1176 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 703 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  22.74 
 
 		 1166 aa  50.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  25.33 
 
 		 765 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  24.07 
 
 		 733 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1602  excinuclease ABC, B subunit  30.91 
 
 		 658 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  25.65 
 
 		 738 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  23.87 
 
 		 1177 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  23.36 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  23.85 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  23.86 
 
 		 823 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  21.36 
 
 		 1103 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  22.11 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  24.69 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  24.85 
 
 		 768 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>