More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1519 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  56.67 
 
 		 794 aa  816    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 		 823 aa  1674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  62.5 
 
 		 806 aa  981    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  48.11 
 
 		 769 aa  700    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  51.26 
 
 		 778 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  59.55 
 
 		 792 aa  931    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.56 
 
 		 758 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.43 
 
 		 752 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.06 
 
 		 752 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  34.5 
 
 		 754 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  30.48 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  30.48 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  30.73 
 
 		 801 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  30.48 
 
 		 801 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.92 
 
 		 751 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  30.11 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  30.36 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  30.36 
 
 		 801 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  30.17 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  30.51 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  30.36 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  30.17 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  31.64 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  34.46 
 
 		 732 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  30.92 
 
 		 732 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  34 
 
 		 813 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  31.1 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  32.89 
 
 		 801 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  35.88 
 
 		 744 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  34.25 
 
 		 746 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  31.27 
 
 		 798 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  37.88 
 
 		 775 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.89 
 
 		 802 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  33.12 
 
 		 749 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  31.56 
 
 		 815 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  29.74 
 
 		 796 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  40.44 
 
 		 858 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.89 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  30.98 
 
 		 809 aa  369  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  35.93 
 
 		 812 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  30.12 
 
 		 798 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  32.75 
 
 		 738 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  30.23 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  30.21 
 
 		 781 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  29.7 
 
 		 802 aa  363  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  29.7 
 
 		 802 aa  363  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  36.51 
 
 		 810 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  31.57 
 
 		 745 aa  363  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  36.9 
 
 		 732 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  35.95 
 
 		 803 aa  362  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  36.38 
 
 		 724 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  30.68 
 
 		 818 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  39.08 
 
 		 746 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.9 
 
 		 739 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  39.73 
 
 		 739 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  31.73 
 
 		 768 aa  356  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  39.59 
 
 		 744 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.82 
 
 		 739 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  39.54 
 
 		 739 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  32.66 
 
 		 723 aa  354  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.81 
 
 		 811 aa  354  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 739 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  36.1 
 
 		 815 aa  351  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  37.48 
 
 		 747 aa  350  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.54 
 
 		 810 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  37.43 
 
 		 812 aa  349  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  39.48 
 
 		 738 aa  349  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  33.03 
 
 		 661 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  33.84 
 
 		 828 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  33 
 
 		 738 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  35.15 
 
 		 731 aa  347  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  37.36 
 
 		 814 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  29.58 
 
 		 815 aa  347  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  38.72 
 
 		 739 aa  346  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  30.67 
 
 		 753 aa  346  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  36.99 
 
 		 733 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  35.95 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  35.15 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  30.12 
 
 		 815 aa  342  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.12 
 
 		 734 aa  341  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  30.56 
 
 		 733 aa  341  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.48 
 
 		 730 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.84 
 
 		 715 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  35.23 
 
 		 810 aa  340  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  36.26 
 
 		 733 aa  340  8e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  40.43 
 
 		 745 aa  339  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  32.88 
 
 		 733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.21 
 
 		 815 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  29.98 
 
 		 831 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  33.55 
 
 		 738 aa  338  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 739 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  38.05 
 
 		 724 aa  337  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  35.84 
 
 		 732 aa  337  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  31.45 
 
 		 731 aa  337  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  32.71 
 
 		 735 aa  337  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  35.84 
 
 		 732 aa  337  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  33.54 
 
 		 849 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  35.84 
 
 		 732 aa  336  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.84 
 
 		 732 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  31.01 
 
 		 733 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>