More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1511 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  63.42 
 
 		 810 aa  1080    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  60.71 
 
 		 810 aa  1010    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  65.84 
 
 		 815 aa  1115    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  100 
 
 		 812 aa  1682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  54.93 
 
 		 812 aa  919    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  53.63 
 
 		 811 aa  897    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  64.9 
 
 		 810 aa  1103    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.27 
 
 		 828 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.77 
 
 		 802 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.17 
 
 		 802 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.17 
 
 		 802 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  37.5 
 
 		 809 aa  527  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.87 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.58 
 
 		 801 aa  502  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  37.61 
 
 		 801 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.32 
 
 		 815 aa  502  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 		 804 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 801 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 801 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 801 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 801 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 801 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.69 
 
 		 801 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  38.71 
 
 		 801 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  37.29 
 
 		 801 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  38.12 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.12 
 
 		 803 aa  489  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  37.95 
 
 		 798 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  35.92 
 
 		 781 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  38.74 
 
 		 738 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.87 
 
 		 803 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  35.77 
 
 		 796 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  42.26 
 
 		 747 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  41.5 
 
 		 732 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.22 
 
 		 818 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  36.09 
 
 		 798 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  40.59 
 
 		 745 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  36.24 
 
 		 824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  41.36 
 
 		 758 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  40.29 
 
 		 730 aa  445  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.55 
 
 		 752 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.55 
 
 		 732 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  36.4 
 
 		 813 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.42 
 
 		 815 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  35.01 
 
 		 802 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  41.98 
 
 		 775 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.05 
 
 		 754 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  39.39 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  42 
 
 		 746 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  34.23 
 
 		 831 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  35.38 
 
 		 815 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  35.62 
 
 		 866 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.48 
 
 		 661 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  33.97 
 
 		 745 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  40.31 
 
 		 735 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  34.1 
 
 		 858 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  34.45 
 
 		 868 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  42.35 
 
 		 724 aa  426  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.42 
 
 		 790 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  42.24 
 
 		 679 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.05 
 
 		 835 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  40.38 
 
 		 715 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  35.88 
 
 		 849 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  40.65 
 
 		 749 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  36.68 
 
 		 815 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.21 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  35.04 
 
 		 914 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  35.6 
 
 		 815 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 770 aa  416  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  34.39 
 
 		 817 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  34.18 
 
 		 815 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  40.07 
 
 		 780 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  41.8 
 
 		 744 aa  416  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  33.72 
 
 		 751 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  33.89 
 
 		 832 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  34.77 
 
 		 848 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  35.84 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  34.48 
 
 		 815 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  35.84 
 
 		 836 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  35.53 
 
 		 825 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  38.02 
 
 		 786 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  32.53 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  37.25 
 
 		 768 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.74 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  40.53 
 
 		 736 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  33.05 
 
 		 814 aa  399  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  38.74 
 
 		 753 aa  393  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  40.33 
 
 		 695 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  41.29 
 
 		 736 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  33.92 
 
 		 835 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  37.21 
 
 		 829 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  40.34 
 
 		 736 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  36.03 
 
 		 738 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  38.74 
 
 		 735 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  37.54 
 
 		 806 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  39.17 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  39.06 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  39.06 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>