More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0259 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  48.67 
 
 		 778 aa  715    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  50.81 
 
 		 806 aa  736    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  48.11 
 
 		 823 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  48.14 
 
 		 794 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  48.98 
 
 		 792 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  100 
 
 		 769 aa  1564    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.87 
 
 		 752 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.56 
 
 		 758 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.81 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  35.74 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.02 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  34.8 
 
 		 743 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  34.68 
 
 		 746 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  32.62 
 
 		 809 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  33.68 
 
 		 754 aa  376  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  35.22 
 
 		 744 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  38.17 
 
 		 732 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.45 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.6 
 
 		 739 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  33.89 
 
 		 768 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  35.06 
 
 		 739 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  31.59 
 
 		 745 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  34.89 
 
 		 739 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  32.31 
 
 		 781 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  32.36 
 
 		 813 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.38 
 
 		 739 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.26 
 
 		 739 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  31.53 
 
 		 798 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  36.71 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  33.93 
 
 		 801 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  38.49 
 
 		 858 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  35.29 
 
 		 740 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.35 
 
 		 732 aa  362  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  35.6 
 
 		 661 aa  362  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  361  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  31.85 
 
 		 725 aa  361  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  361  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  361  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  31.85 
 
 		 725 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  37.66 
 
 		 679 aa  361  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 801 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  39.45 
 
 		 730 aa  360  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  38.95 
 
 		 828 aa  360  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  33.17 
 
 		 801 aa  360  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  34.55 
 
 		 749 aa  359  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  30.91 
 
 		 815 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  30.06 
 
 		 803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.94 
 
 		 774 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  35.18 
 
 		 804 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  41.42 
 
 		 745 aa  357  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  35.36 
 
 		 802 aa  356  1e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  33.11 
 
 		 801 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  34.3 
 
 		 739 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  34.43 
 
 		 802 aa  354  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  34.43 
 
 		 802 aa  354  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.37 
 
 		 815 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  30.74 
 
 		 796 aa  352  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  34.05 
 
 		 739 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.56 
 
 		 747 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  35.71 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  33.86 
 
 		 733 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  35.82 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  34.39 
 
 		 744 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.48 
 
 		 818 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  34.23 
 
 		 810 aa  347  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  31.07 
 
 		 803 aa  347  7e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 724 aa  346  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.06 
 
 		 802 aa  346  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  35.33 
 
 		 812 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  29.91 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  37.14 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  39.81 
 
 		 738 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  38.4 
 
 		 749 aa  344  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  35.75 
 
 		 815 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  36.96 
 
 		 662 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  30.13 
 
 		 731 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  35.17 
 
 		 812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  33.17 
 
 		 814 aa  341  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  33.12 
 
 		 745 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  33.39 
 
 		 810 aa  340  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0248  primosomal protein N'  34.86 
 
 		 731 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000476665  normal  0.18889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  33.64 
 
 		 732 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  32.26 
 
 		 731 aa  336  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  32.73 
 
 		 731 aa  336  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  31.09 
 
 		 775 aa  336  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  37.76 
 
 		 724 aa  336  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  38.43 
 
 		 753 aa  336  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  36.32 
 
 		 735 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  29.59 
 
 		 798 aa  336  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  39.92 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  34.01 
 
 		 724 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  37.02 
 
 		 831 aa  334  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  31.47 
 
 		 738 aa  334  4e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  31.45 
 
 		 723 aa  333  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.88 
 
 		 815 aa  333  9e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  34.17 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>