More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1781 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  48.98 
 
 		 769 aa  703    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  59.55 
 
 		 823 aa  931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  52.15 
 
 		 778 aa  758    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  57.09 
 
 		 794 aa  819    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  100 
 
 		 792 aa  1596    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  65.96 
 
 		 806 aa  1040    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  33.91 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  33.62 
 
 		 801 aa  429  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  33.17 
 
 		 801 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  33 
 
 		 801 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  33.42 
 
 		 801 aa  426  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  32.96 
 
 		 801 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  34.39 
 
 		 801 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  31.7 
 
 		 801 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 752 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.08 
 
 		 758 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  34.54 
 
 		 809 aa  411  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  36.67 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.28 
 
 		 803 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  42.08 
 
 		 751 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 752 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  36.64 
 
 		 754 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  34.89 
 
 		 744 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.85 
 
 		 738 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  37.58 
 
 		 732 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.01 
 
 		 746 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  31.75 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  31.2 
 
 		 796 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  31.92 
 
 		 818 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  32.45 
 
 		 781 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  32.99 
 
 		 798 aa  385  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  31.3 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.01 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  31.23 
 
 		 798 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.66 
 
 		 732 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  40.41 
 
 		 724 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  32.78 
 
 		 745 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  31.17 
 
 		 802 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  35.61 
 
 		 812 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  34.68 
 
 		 828 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  32.46 
 
 		 813 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.69 
 
 		 775 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.24 
 
 		 739 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  29.79 
 
 		 802 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  34.37 
 
 		 739 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  29.79 
 
 		 802 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  44.06 
 
 		 745 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  33.88 
 
 		 768 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.57 
 
 		 774 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  32.1 
 
 		 747 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  35.24 
 
 		 724 aa  369  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  35.2 
 
 		 815 aa  365  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  34.99 
 
 		 733 aa  361  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  34.63 
 
 		 739 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.6 
 
 		 810 aa  361  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.86 
 
 		 811 aa  361  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 		 739 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  34.97 
 
 		 810 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  40.44 
 
 		 738 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  30.54 
 
 		 803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  40.36 
 
 		 858 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  33.1 
 
 		 715 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  33.11 
 
 		 723 aa  357  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  40.37 
 
 		 744 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.97 
 
 		 730 aa  356  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  39.93 
 
 		 739 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  36.67 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  38 
 
 		 679 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  37.85 
 
 		 736 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  34.3 
 
 		 849 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  36.5 
 
 		 736 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  36.95 
 
 		 810 aa  354  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  30.79 
 
 		 815 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  39.63 
 
 		 739 aa  353  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  36.31 
 
 		 727 aa  353  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  39.55 
 
 		 740 aa  353  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  36.12 
 
 		 736 aa  353  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  39.74 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  35.12 
 
 		 812 aa  352  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  39.74 
 
 		 739 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  35.47 
 
 		 738 aa  351  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  38.9 
 
 		 738 aa  351  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  39.18 
 
 		 749 aa  351  4e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  36.72 
 
 		 735 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  38.14 
 
 		 732 aa  351  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  35.05 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  39.56 
 
 		 746 aa  350  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 661 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  36.12 
 
 		 736 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  37.27 
 
 		 734 aa  349  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  39.93 
 
 		 738 aa  349  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  37.08 
 
 		 744 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  32.07 
 
 		 914 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  33.29 
 
 		 732 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  35.53 
 
 		 734 aa  348  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>