More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0682 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.38 
 
 		 758 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  67.74 
 
 		 743 aa  961    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  54.5 
 
 		 747 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  54.5 
 
 		 747 aa  836    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  77.44 
 
 		 755 aa  1100    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 		 749 aa  1493    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.38 
 
 		 758 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  43.77 
 
 		 757 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  44.92 
 
 		 758 aa  720    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  60.08 
 
 		 753 aa  917    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  38.1 
 
 		 914 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  37.17 
 
 		 849 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  39.98 
 
 		 836 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  38.03 
 
 		 843 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 835 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  43.89 
 
 		 848 aa  495  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  45.38 
 
 		 825 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  44.87 
 
 		 806 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  44.91 
 
 		 801 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.51 
 
 		 804 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.06 
 
 		 732 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  42.07 
 
 		 801 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  40.5 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  42.47 
 
 		 801 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  426  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  42.27 
 
 		 801 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.46 
 
 		 802 aa  422  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.34 
 
 		 802 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  40.45 
 
 		 801 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.34 
 
 		 802 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  33.51 
 
 		 745 aa  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  40.31 
 
 		 732 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  41.61 
 
 		 809 aa  411  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.53 
 
 		 747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  35.5 
 
 		 749 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.47 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  37 
 
 		 731 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.43 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.71 
 
 		 735 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  38.01 
 
 		 815 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.64 
 
 		 828 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  36.82 
 
 		 781 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.68 
 
 		 775 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.77 
 
 		 798 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.13 
 
 		 746 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  43.9 
 
 		 866 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  38.42 
 
 		 740 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 868 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  35.56 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  40.94 
 
 		 803 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.07 
 
 		 743 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  37.1 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  35.52 
 
 		 738 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 		 796 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.83 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 724 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.08 
 
 		 752 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.56 
 
 		 818 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.43 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 		 798 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.24 
 
 		 739 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.24 
 
 		 739 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  38.35 
 
 		 739 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.38 
 
 		 739 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.07 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.16 
 
 		 739 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.31 
 
 		 739 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  38.25 
 
 		 835 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.95 
 
 		 739 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  37.06 
 
 		 831 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.24 
 
 		 746 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  41.43 
 
 		 805 aa  366  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  35.64 
 
 		 768 aa  364  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  39.51 
 
 		 804 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  36.85 
 
 		 744 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  33.64 
 
 		 754 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.83 
 
 		 725 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  34.86 
 
 		 811 aa  362  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  39.18 
 
 		 792 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  39.57 
 
 		 813 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.39 
 
 		 739 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  36.38 
 
 		 815 aa  359  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  35.04 
 
 		 812 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  40.47 
 
 		 730 aa  359  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  34.44 
 
 		 810 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  32.11 
 
 		 790 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  34.62 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  39.46 
 
 		 815 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  27.6 
 
 		 715 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.51 
 
 		 725 aa  357  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  40.57 
 
 		 815 aa  357  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  38.4 
 
 		 769 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  36.68 
 
 		 815 aa  356  8.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  36.51 
 
 		 744 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  41.02 
 
 		 732 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>