More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0651 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  55.11 
 
 
825 aa  846    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  52.73 
 
 
849 aa  814    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  54.62 
 
 
835 aa  851    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  54.09 
 
 
843 aa  849    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  100 
 
 
806 aa  1627    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  55.23 
 
 
836 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  51.39 
 
 
848 aa  809    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  49.29 
 
 
914 aa  784    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  38.44 
 
 
801 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.09 
 
 
802 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.12 
 
 
802 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 
801 aa  539  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 
801 aa  539  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 
801 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 
801 aa  539  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  38.19 
 
 
801 aa  539  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.12 
 
 
802 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.81 
 
 
801 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  38.07 
 
 
801 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.81 
 
 
801 aa  535  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  38.27 
 
 
801 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.8 
 
 
804 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.47 
 
 
801 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.11 
 
 
801 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  42.04 
 
 
745 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  49.91 
 
 
732 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.84 
 
 
809 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.78 
 
 
775 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  42.88 
 
 
732 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.37 
 
 
753 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.94 
 
 
818 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  35.43 
 
 
749 aa  492  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  42.76 
 
 
747 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  43.2 
 
 
747 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.78 
 
 
747 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 
781 aa  479  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  39.93 
 
 
755 aa  475  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.36 
 
 
815 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  48.58 
 
 
743 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.62 
 
 
731 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.8 
 
 
751 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.46 
 
 
731 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  45.71 
 
 
732 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  44.87 
 
 
749 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.14 
 
 
770 aa  462  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.07 
 
 
758 aa  459  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  35.76 
 
 
786 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.25 
 
 
754 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.89 
 
 
752 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  38.93 
 
 
828 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.52 
 
 
752 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  35.01 
 
 
798 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  35.54 
 
 
815 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.44 
 
 
758 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  36.66 
 
 
780 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.91 
 
 
803 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.75 
 
 
758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  45.97 
 
 
768 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  43.31 
 
 
835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  37.65 
 
 
866 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  44.48 
 
 
758 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  38.29 
 
 
858 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  43.76 
 
 
735 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.33 
 
 
802 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  35.18 
 
 
798 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.36 
 
 
815 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  44.17 
 
 
744 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  38.93 
 
 
868 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  34 
 
 
796 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  36.65 
 
 
805 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  42.31 
 
 
746 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  41.55 
 
 
757 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  35.16 
 
 
813 aa  429  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  33.05 
 
 
803 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  43.34 
 
 
730 aa  426  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  42.55 
 
 
695 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  46.97 
 
 
736 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  42.62 
 
 
810 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  35.18 
 
 
815 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  42.91 
 
 
745 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  39.41 
 
 
724 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  40.38 
 
 
810 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  31.85 
 
 
790 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  39.05 
 
 
661 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  46.59 
 
 
736 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  39.23 
 
 
811 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  40.41 
 
 
792 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  44.7 
 
 
829 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  42.91 
 
 
804 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  40.94 
 
 
738 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  45.83 
 
 
736 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  40.38 
 
 
735 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  38.01 
 
 
812 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  38.48 
 
 
831 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  44.14 
 
 
724 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  41.37 
 
 
815 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  44.75 
 
 
821 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  37.17 
 
 
814 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  41.44 
 
 
679 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  32.12 
 
 
824 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>