More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05241 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.35 
 
 		 747 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 		 758 aa  1551    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  69.27 
 
 		 757 aa  1117    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  45.65 
 
 		 755 aa  703    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  45.38 
 
 		 749 aa  716    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  88.52 
 
 		 758 aa  1392    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.07 
 
 		 753 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  44.89 
 
 		 743 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.75 
 
 		 747 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  95.65 
 
 		 758 aa  1469    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  40.72 
 
 		 825 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  34.76 
 
 		 835 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  34.42 
 
 		 843 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  43.96 
 
 		 848 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  44.78 
 
 		 836 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  34.66 
 
 		 914 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  40.44 
 
 		 849 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  34.44 
 
 		 806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  36.22 
 
 		 732 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  35.12 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.59 
 
 		 804 aa  416  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  35.58 
 
 		 745 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.52 
 
 		 802 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.93 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.52 
 
 		 802 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  39.46 
 
 		 781 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.43 
 
 		 802 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  38.67 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  38.45 
 
 		 801 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  38.45 
 
 		 801 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.03 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  39 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  41.07 
 
 		 809 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.15 
 
 		 747 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  33.12 
 
 		 749 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  39.13 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.42 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.6 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  39.09 
 
 		 798 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  33.67 
 
 		 735 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.65 
 
 		 798 aa  375  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  40.12 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.39 
 
 		 775 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  36.05 
 
 		 790 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.95 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.37 
 
 		 835 aa  363  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  36.89 
 
 		 828 aa  361  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  38.5 
 
 		 803 aa  360  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  38.42 
 
 		 804 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  39.01 
 
 		 818 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  34.8 
 
 		 770 aa  355  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.86 
 
 		 815 aa  354  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  39.11 
 
 		 724 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  37.6 
 
 		 866 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  38.43 
 
 		 813 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  37.8 
 
 		 831 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  33.05 
 
 		 723 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.41 
 
 		 739 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.41 
 
 		 739 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  38.38 
 
 		 815 aa  346  7e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  38.82 
 
 		 815 aa  346  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  35.08 
 
 		 739 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.08 
 
 		 746 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  35.1 
 
 		 730 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  33.23 
 
 		 732 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  31.97 
 
 		 738 aa  344  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  36.4 
 
 		 868 aa  344  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.58 
 
 		 746 aa  344  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.69 
 
 		 743 aa  343  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  39.63 
 
 		 815 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  35.9 
 
 		 695 aa  341  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  34.59 
 
 		 815 aa  341  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 732 aa  341  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  36.16 
 
 		 824 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 732 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  36.92 
 
 		 768 aa  339  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.97 
 
 		 758 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  31.86 
 
 		 745 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  33.77 
 
 		 730 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  34.44 
 
 		 753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  33.85 
 
 		 802 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  33.18 
 
 		 732 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  33.18 
 
 		 732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  33.18 
 
 		 732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  33.18 
 
 		 732 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  33.18 
 
 		 732 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  36.15 
 
 		 661 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  36.23 
 
 		 829 aa  337  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  33.18 
 
 		 732 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  31.4 
 
 		 733 aa  337  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  32.91 
 
 		 732 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.6 
 
 		 725 aa  337  7e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.42 
 
 		 752 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  30.8 
 
 		 731 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>