More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05611 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.62 
 
 		 747 aa  722    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.37 
 
 		 743 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  44.91 
 
 		 755 aa  676    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  43.77 
 
 		 749 aa  688    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.42 
 
 		 747 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  70.2 
 
 		 758 aa  1122    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  69.27 
 
 		 758 aa  1102    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  69.27 
 
 		 758 aa  1107    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 		 757 aa  1561    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.34 
 
 		 753 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  39.01 
 
 		 848 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  39.9 
 
 		 835 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  38.75 
 
 		 825 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  39.14 
 
 		 843 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  41.51 
 
 		 914 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  37.66 
 
 		 849 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  42.16 
 
 		 836 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  42.75 
 
 		 806 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  41.99 
 
 		 804 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  40.67 
 
 		 802 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.2 
 
 		 732 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  40.67 
 
 		 802 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.37 
 
 		 801 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  34.52 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 801 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.91 
 
 		 781 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  37.63 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  37.61 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  37.61 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  37.61 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  39.11 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  37.97 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  37.8 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  37.8 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  40.15 
 
 		 731 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.59 
 
 		 801 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 731 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  39.24 
 
 		 749 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  38.93 
 
 		 801 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.21 
 
 		 745 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  40.66 
 
 		 798 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.13 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  40.33 
 
 		 809 aa  382  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  39.53 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  38.13 
 
 		 747 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  34.11 
 
 		 803 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  39.06 
 
 		 798 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  39.66 
 
 		 818 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.07 
 
 		 835 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.99 
 
 		 775 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  39.06 
 
 		 796 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  34.58 
 
 		 735 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  38.21 
 
 		 815 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.2 
 
 		 803 aa  363  9e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  38.29 
 
 		 828 aa  357  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  38.07 
 
 		 752 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  37.67 
 
 		 866 aa  353  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  39.18 
 
 		 831 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  33.6 
 
 		 738 aa  353  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  34.78 
 
 		 790 aa  352  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.96 
 
 		 754 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  38.51 
 
 		 813 aa  350  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.35 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.06 
 
 		 815 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  37.69 
 
 		 752 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  32.62 
 
 		 746 aa  346  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 815 aa  345  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  32.99 
 
 		 740 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 739 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  36.87 
 
 		 815 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  35.42 
 
 		 778 aa  344  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 739 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  37.05 
 
 		 868 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  35.17 
 
 		 732 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35 
 
 		 732 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  34.89 
 
 		 751 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  34.16 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  35.33 
 
 		 732 aa  339  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  33.94 
 
 		 746 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  37.74 
 
 		 661 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  35 
 
 		 732 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  30.56 
 
 		 786 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  37.32 
 
 		 804 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 732 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  34.83 
 
 		 732 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  34.83 
 
 		 732 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 732 aa  336  9e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 732 aa  336  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  34.05 
 
 		 723 aa  336  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  33.22 
 
 		 770 aa  335  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  34.22 
 
 		 768 aa  335  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.61 
 
 		 725 aa  334  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  37.78 
 
 		 724 aa  334  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  32.57 
 
 		 758 aa  334  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.92 
 
 		 815 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  35.88 
 
 		 829 aa  333  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  37.07 
 
 		 780 aa  333  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  33.67 
 
 		 732 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  33.67 
 
 		 732 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  31.18 
 
 		 732 aa  331  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>