More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1308 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  63.75 
 
 
695 aa  717    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  100 
 
 
780 aa  1568    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  63.06 
 
 
786 aa  984    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  51.45 
 
 
770 aa  744    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.08 
 
 
802 aa  567  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.89 
 
 
802 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.89 
 
 
802 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.38 
 
 
804 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.2 
 
 
801 aa  549  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  38.92 
 
 
749 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  35.62 
 
 
815 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  35.93 
 
 
732 aa  522  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.39 
 
 
781 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.32 
 
 
801 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  36.74 
 
 
745 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  38.75 
 
 
732 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  37.29 
 
 
747 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  37.89 
 
 
798 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.64 
 
 
735 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  40.76 
 
 
758 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  45.35 
 
 
825 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  46.88 
 
 
809 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  34.01 
 
 
731 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  34.46 
 
 
803 aa  495  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.78 
 
 
818 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  46.91 
 
 
798 aa  491  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  33.63 
 
 
731 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 
801 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  41.15 
 
 
801 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  42.09 
 
 
744 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  38.82 
 
 
752 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  38.42 
 
 
836 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  35.75 
 
 
914 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.63 
 
 
752 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  42.21 
 
 
796 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  39.92 
 
 
746 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.8 
 
 
768 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  41.37 
 
 
849 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  36.06 
 
 
835 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  38.87 
 
 
754 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  41.88 
 
 
835 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  35.81 
 
 
775 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  35.84 
 
 
843 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  42.25 
 
 
815 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  41.97 
 
 
848 aa  465  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.08 
 
 
790 aa  462  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.95 
 
 
751 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  45.47 
 
 
828 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  37.28 
 
 
738 aa  459  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.58 
 
 
730 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  41.16 
 
 
815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  36.22 
 
 
792 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  44.42 
 
 
803 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.23 
 
 
732 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 
806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  33.55 
 
 
724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  34.62 
 
 
815 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  43.62 
 
 
815 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  43.62 
 
 
810 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  40.36 
 
 
829 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  40.99 
 
 
810 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  44.84 
 
 
858 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  40.28 
 
 
812 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  39.13 
 
 
661 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  43.45 
 
 
868 aa  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  43.53 
 
 
813 aa  436  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  37.79 
 
 
738 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  41.95 
 
 
810 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  43.91 
 
 
821 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  41.29 
 
 
866 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  38.83 
 
 
814 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  39.19 
 
 
736 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  40.13 
 
 
735 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  40.07 
 
 
812 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  40.78 
 
 
802 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3727  primosomal protein N'  40.49 
 
 
745 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  40.33 
 
 
815 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  38.54 
 
 
736 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.25 
 
 
811 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  40.39 
 
 
824 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  38.42 
 
 
736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  36.43 
 
 
745 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.75 
 
 
739 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.5 
 
 
739 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  39.36 
 
 
804 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  36.33 
 
 
815 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.33 
 
 
743 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  32.38 
 
 
753 aa  395  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.74 
 
 
739 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  36.41 
 
 
715 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.49 
 
 
739 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 
734 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>