More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1169 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  100 
 
 		 811 aa  1685    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  54.93 
 
 		 810 aa  904    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  53.63 
 
 		 812 aa  884    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  52.77 
 
 		 810 aa  852    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  52.64 
 
 		 815 aa  885    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  65.35 
 
 		 812 aa  1108    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  55.61 
 
 		 810 aa  933    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.27 
 
 		 802 aa  548  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.31 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  35.14 
 
 		 802 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  35.14 
 
 		 802 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  44.21 
 
 		 798 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  35.24 
 
 		 809 aa  499  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  34.86 
 
 		 801 aa  499  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 		 801 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.86 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  34.91 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  34.91 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.86 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  35.65 
 
 		 801 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  34.62 
 
 		 801 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 		 801 aa  492  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  34.93 
 
 		 804 aa  492  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  35.48 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  46.36 
 
 		 781 aa  490  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 		 801 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  34.37 
 
 		 801 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  42.39 
 
 		 738 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  35.54 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  40.29 
 
 		 732 aa  485  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  42.39 
 
 		 798 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  40.16 
 
 		 747 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.76 
 
 		 803 aa  473  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  41.38 
 
 		 745 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  36.25 
 
 		 858 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  39.39 
 
 		 796 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  34.7 
 
 		 803 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.82 
 
 		 815 aa  465  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  31.62 
 
 		 815 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  44.04 
 
 		 758 aa  465  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  40.5 
 
 		 813 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  33.45 
 
 		 815 aa  466  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.74 
 
 		 732 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  41.1 
 
 		 732 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 752 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  40.61 
 
 		 749 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  33.7 
 
 		 818 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  41.41 
 
 		 751 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  34.22 
 
 		 824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  34.94 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.87 
 
 		 752 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  36.28 
 
 		 815 aa  445  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  38.78 
 
 		 745 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  36.17 
 
 		 815 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 		 914 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  34.62 
 
 		 815 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  41.65 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.53 
 
 		 802 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  42.14 
 
 		 754 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.91 
 
 		 730 aa  435  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.83 
 
 		 661 aa  435  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  41.04 
 
 		 746 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  32.76 
 
 		 731 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  35.32 
 
 		 825 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.51 
 
 		 815 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  36.29 
 
 		 744 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  37.91 
 
 		 715 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  32.44 
 
 		 804 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  35.65 
 
 		 866 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.58 
 
 		 743 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  37.89 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  33.52 
 
 		 817 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  34.47 
 
 		 848 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  31.94 
 
 		 790 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  43.21 
 
 		 735 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 868 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 		 732 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 		 732 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  40.15 
 
 		 724 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 		 732 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  40.77 
 
 		 679 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  34.62 
 
 		 814 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  37.76 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  38.88 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  39.04 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  34.29 
 
 		 849 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  34.96 
 
 		 815 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  41.04 
 
 		 768 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 		 732 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 733 aa  418  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  34.22 
 
 		 835 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  31.14 
 
 		 832 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  38.88 
 
 		 732 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  38.73 
 
 		 732 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  38.88 
 
 		 732 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  38.88 
 
 		 732 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  39.24 
 
 		 732 aa  416  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  39.18 
 
 		 732 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  34.47 
 
 		 821 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  38.88 
 
 		 732 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>