More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2493 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  100 
 
 		 792 aa  1625    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  42.03 
 
 		 732 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.07 
 
 		 745 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 732 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  38.68 
 
 		 747 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  43.59 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  35.44 
 
 		 802 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  43.07 
 
 		 731 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  39.42 
 
 		 801 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  39.42 
 
 		 801 aa  532  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.81 
 
 		 804 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.93 
 
 		 801 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  35.79 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  40.25 
 
 		 796 aa  522  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 802 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 802 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 801 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  46.77 
 
 		 801 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  46.4 
 
 		 801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  46.77 
 
 		 801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  34.54 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 749 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  39.34 
 
 		 781 aa  512  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  41.93 
 
 		 815 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.35 
 
 		 798 aa  509  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  38.48 
 
 		 803 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  34.82 
 
 		 775 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  39.08 
 
 		 724 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  38.13 
 
 		 798 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  35.66 
 
 		 730 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  37.3 
 
 		 790 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  44.02 
 
 		 818 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  36.82 
 
 		 738 aa  471  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  36.53 
 
 		 786 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.66 
 
 		 752 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.53 
 
 		 758 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.66 
 
 		 752 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  36.89 
 
 		 780 aa  459  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  33.63 
 
 		 768 aa  458  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.95 
 
 		 754 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 868 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  43.07 
 
 		 825 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 744 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  39.77 
 
 		 815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  36.64 
 
 		 770 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  41.31 
 
 		 803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  43.77 
 
 		 835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.91 
 
 		 835 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.04 
 
 		 746 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  43.13 
 
 		 805 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  42.4 
 
 		 815 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.9 
 
 		 774 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  42.94 
 
 		 843 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  46.62 
 
 		 661 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  35.76 
 
 		 753 aa  437  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  33.16 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  36.87 
 
 		 914 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  36.07 
 
 		 745 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  40.34 
 
 		 821 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  38.72 
 
 		 866 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  41.09 
 
 		 813 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.89 
 
 		 802 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  34.75 
 
 		 732 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  36.61 
 
 		 848 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  38.36 
 
 		 836 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 828 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  39.8 
 
 		 829 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  43.95 
 
 		 815 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  34.7 
 
 		 849 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  36.04 
 
 		 736 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  40.41 
 
 		 806 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  31.2 
 
 		 739 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  34.92 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  36.34 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  36.41 
 
 		 736 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  30.43 
 
 		 746 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  30.7 
 
 		 739 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  35.4 
 
 		 735 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  36.25 
 
 		 736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  43.39 
 
 		 679 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  37.05 
 
 		 724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  30.58 
 
 		 739 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  35.51 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.51 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  43.64 
 
 		 715 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  35.51 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  32.48 
 
 		 732 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  32.48 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  34.98 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  45.48 
 
 		 858 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  30.58 
 
 		 739 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  44.91 
 
 		 815 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  32.35 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  32.35 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  42.02 
 
 		 804 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>