More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04971 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 		 753 aa  1541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.5 
 
 		 747 aa  929    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.36 
 
 		 747 aa  925    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  65.05 
 
 		 743 aa  979    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.34 
 
 		 757 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  61.52 
 
 		 755 aa  883    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  60.08 
 
 		 749 aa  899    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.53 
 
 		 758 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.74 
 
 		 758 aa  719    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.07 
 
 		 758 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  40.7 
 
 		 849 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  36.37 
 
 		 914 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  38.97 
 
 		 806 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  43.3 
 
 		 848 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  41.29 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  44.57 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  43.43 
 
 		 836 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  40.36 
 
 		 843 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  42.44 
 
 		 804 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40 
 
 		 801 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  40.74 
 
 		 732 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  40.33 
 
 		 801 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  40.33 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  40.33 
 
 		 801 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.71 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  37.66 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  39.54 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  39.54 
 
 		 801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.5 
 
 		 745 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.42 
 
 		 732 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.37 
 
 		 802 aa  399  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.37 
 
 		 802 aa  399  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.78 
 
 		 747 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  38.7 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  37.76 
 
 		 798 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.4 
 
 		 809 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  33.38 
 
 		 731 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  34.77 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  35.29 
 
 		 749 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  36.82 
 
 		 731 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.56 
 
 		 775 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  39.38 
 
 		 798 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  35.63 
 
 		 732 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.82 
 
 		 815 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  41.7 
 
 		 866 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.42 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  39.71 
 
 		 828 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  38.96 
 
 		 796 aa  372  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  35.04 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  35.73 
 
 		 815 aa  369  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.48 
 
 		 751 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.14 
 
 		 752 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  36.6 
 
 		 835 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 758 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  38.4 
 
 		 744 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 739 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.76 
 
 		 803 aa  368  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  34.72 
 
 		 813 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  36.84 
 
 		 815 aa  364  4e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  39.42 
 
 		 746 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.54 
 
 		 752 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.01 
 
 		 739 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  39.96 
 
 		 695 aa  362  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  40.7 
 
 		 868 aa  360  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.85 
 
 		 818 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  33.04 
 
 		 754 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  38.22 
 
 		 804 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  41.79 
 
 		 780 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  40.25 
 
 		 739 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.57 
 
 		 790 aa  357  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  38.34 
 
 		 815 aa  354  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  37 
 
 		 724 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.58 
 
 		 739 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  34.46 
 
 		 715 aa  353  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  35.83 
 
 		 815 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  37.5 
 
 		 858 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.58 
 
 		 739 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  35.47 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  40.33 
 
 		 805 aa  350  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.63 
 
 		 743 aa  350  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  34.89 
 
 		 661 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  41.39 
 
 		 739 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.55 
 
 		 746 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.39 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.28 
 
 		 725 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  33.94 
 
 		 768 aa  347  5e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  37.15 
 
 		 829 aa  347  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.32 
 
 		 739 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  39.39 
 
 		 770 aa  346  8.999999999999999e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 		 740 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 		 817 aa  344  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  33.62 
 
 		 723 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  36.87 
 
 		 679 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.95 
 
 		 725 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  34.23 
 
 		 731 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  35.08 
 
 		 730 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>