More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1830 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.68 
 
 		 743 aa  917    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  97.86 
 
 		 747 aa  1504    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 		 747 aa  1537    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.62 
 
 		 757 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  57.51 
 
 		 755 aa  836    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  54.5 
 
 		 749 aa  818    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.25 
 
 		 758 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.35 
 
 		 758 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.36 
 
 		 753 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.54 
 
 		 758 aa  706    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  42.17 
 
 		 849 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  44.25 
 
 		 825 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  38.41 
 
 		 848 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  41.08 
 
 		 914 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  42.95 
 
 		 835 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  42.41 
 
 		 843 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  43.64 
 
 		 836 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  43.2 
 
 		 806 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.55 
 
 		 801 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  39.12 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  41.67 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  40.95 
 
 		 804 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  39.12 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  39.3 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  39.96 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  38.75 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  38.77 
 
 		 801 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.53 
 
 		 745 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.56 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  37.86 
 
 		 815 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.59 
 
 		 802 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.59 
 
 		 802 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  41.12 
 
 		 749 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  41.03 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.94 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  40.04 
 
 		 809 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  37.77 
 
 		 828 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.94 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.98 
 
 		 775 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 735 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  41.13 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  39.27 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.64 
 
 		 781 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  34.4 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.39 
 
 		 732 aa  366  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.97 
 
 		 752 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  36.85 
 
 		 818 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 796 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  39.92 
 
 		 798 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.79 
 
 		 815 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.13 
 
 		 798 aa  362  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.96 
 
 		 752 aa  361  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  40.32 
 
 		 866 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  40.95 
 
 		 770 aa  359  8e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  35.43 
 
 		 815 aa  359  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  33.8 
 
 		 723 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.46 
 
 		 746 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.22 
 
 		 768 aa  356  7.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  40.86 
 
 		 730 aa  356  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  34.8 
 
 		 813 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  37.23 
 
 		 695 aa  353  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  38.89 
 
 		 868 aa  353  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  36.38 
 
 		 724 aa  353  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  39.36 
 
 		 780 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  38.81 
 
 		 835 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.26 
 
 		 754 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  37.23 
 
 		 803 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  37.78 
 
 		 803 aa  351  4e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  39.52 
 
 		 744 aa  351  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  30.87 
 
 		 786 aa  350  5e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  32.69 
 
 		 790 aa  349  9e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  38.58 
 
 		 821 aa  349  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38.14 
 
 		 739 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.31 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.57 
 
 		 746 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  39.44 
 
 		 719 aa  347  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.89 
 
 		 739 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.04 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.04 
 
 		 739 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  38.09 
 
 		 745 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.04 
 
 		 739 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  38.33 
 
 		 725 aa  342  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  37.76 
 
 		 731 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  36.59 
 
 		 679 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  34.98 
 
 		 815 aa  341  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  38.22 
 
 		 725 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  42.06 
 
 		 792 aa  341  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.5 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.38 
 
 		 815 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  37.7 
 
 		 829 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  37.34 
 
 		 739 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  34.9 
 
 		 811 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  34.92 
 
 		 858 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>