More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07311 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  65.05 
 
 
753 aa  1005    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.68 
 
 
747 aa  940    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  44.09 
 
 
758 aa  713    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  59.27 
 
 
747 aa  937    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  69.8 
 
 
755 aa  944    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  67.74 
 
 
749 aa  973    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.16 
 
 
758 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.37 
 
 
757 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 
743 aa  1493    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  44.89 
 
 
758 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  43.59 
 
 
914 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  44.25 
 
 
849 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  38.47 
 
 
848 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  41.06 
 
 
836 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  44.5 
 
 
825 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  43.89 
 
 
835 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  43.02 
 
 
843 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  46.2 
 
 
806 aa  482  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  41.24 
 
 
804 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.89 
 
 
801 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.99 
 
 
732 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  40.65 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  416  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  40.5 
 
 
801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 
801 aa  416  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  40.5 
 
 
801 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  39.75 
 
 
801 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.58 
 
 
745 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.56 
 
 
802 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.56 
 
 
802 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  38.57 
 
 
732 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.77 
 
 
802 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  39.29 
 
 
781 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  40.24 
 
 
809 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.62 
 
 
747 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.77 
 
 
758 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  44.72 
 
 
828 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  40.04 
 
 
749 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  39.22 
 
 
731 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  39.02 
 
 
731 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  37.74 
 
 
732 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.68 
 
 
815 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  41.52 
 
 
752 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  39.05 
 
 
803 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  41.73 
 
 
798 aa  383  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  43.16 
 
 
751 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  36.69 
 
 
796 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  41.35 
 
 
746 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.86 
 
 
775 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  41.33 
 
 
752 aa  379  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  37.16 
 
 
723 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  39.49 
 
 
813 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  40.81 
 
 
868 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  43.48 
 
 
866 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.88 
 
 
739 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  38.1 
 
 
798 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  39.78 
 
 
754 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.63 
 
 
730 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  38.6 
 
 
803 aa  372  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  38.55 
 
 
835 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.56 
 
 
818 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.32 
 
 
735 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  39.85 
 
 
739 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  40.66 
 
 
780 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  39.1 
 
 
858 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.63 
 
 
743 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  31.84 
 
 
715 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  38.72 
 
 
744 aa  364  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  40.73 
 
 
805 aa  363  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.44 
 
 
815 aa  363  8e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  39.41 
 
 
768 aa  363  9e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 
740 aa  361  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  32.65 
 
 
790 aa  360  7e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.36 
 
 
770 aa  359  8e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  37.38 
 
 
739 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  38.19 
 
 
804 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  42.83 
 
 
739 aa  358  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  34.76 
 
 
732 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  36.61 
 
 
746 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  34.76 
 
 
732 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  38.74 
 
 
745 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  34.76 
 
 
731 aa  355  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.98 
 
 
815 aa  353  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.92 
 
 
739 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  34.54 
 
 
732 aa  353  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  40.91 
 
 
739 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  40.55 
 
 
744 aa  353  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  34.71 
 
 
731 aa  353  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  35.63 
 
 
753 aa  352  1e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  36.44 
 
 
815 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 
739 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  36.98 
 
 
724 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  36.38 
 
 
812 aa  352  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  36.1 
 
 
811 aa  351  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  41.7 
 
 
814 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>