More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0498 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.25 
 
 		 747 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05541  primosomal protein N' (replication factor Y)  88.92 
 
 		 758 aa  1375    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.311989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  45.38 
 
 		 755 aa  695    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  45.38 
 
 		 749 aa  716    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07311  primosomal protein N' (replication factor Y)  45.16 
 
 		 743 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0498  primosomal protein N' (replication factor Y)  100 
 
 		 758 aa  1547    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  70.2 
 
 		 757 aa  1122    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.38 
 
 		 747 aa  718    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  46.53 
 
 		 753 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05241  primosomal protein N' (replication factor Y)  88.52 
 
 		 758 aa  1371    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  39.63 
 
 		 825 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  40.37 
 
 		 835 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 		 843 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  43.47 
 
 		 836 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  39.62 
 
 		 849 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  34.26 
 
 		 848 aa  459  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  33.45 
 
 		 914 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  34.19 
 
 		 806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.61 
 
 		 732 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.39 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.74 
 
 		 804 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.69 
 
 		 745 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.27 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  39.19 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  39.19 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  32.69 
 
 		 802 aa  389  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  38.1 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  38.83 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 801 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  39.38 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  39.34 
 
 		 731 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 801 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 781 aa  388  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 		 801 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 		 801 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 		 801 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  37.36 
 
 		 801 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  32.49 
 
 		 749 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  37.36 
 
 		 801 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  40.66 
 
 		 809 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  37.38 
 
 		 801 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  33.38 
 
 		 747 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  37.94 
 
 		 805 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.4 
 
 		 798 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  38.46 
 
 		 798 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  33.28 
 
 		 735 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 796 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  33.87 
 
 		 835 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  37.27 
 
 		 828 aa  363  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.59 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  37.97 
 
 		 803 aa  357  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  35.97 
 
 		 790 aa  354  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  39.63 
 
 		 724 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  37.59 
 
 		 803 aa  351  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  36.76 
 
 		 866 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  35.9 
 
 		 695 aa  350  5e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  37.03 
 
 		 804 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  35.96 
 
 		 815 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  36.85 
 
 		 831 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  30.96 
 
 		 770 aa  346  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  36.27 
 
 		 730 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  29.57 
 
 		 786 aa  345  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  38.56 
 
 		 818 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  35.98 
 
 		 868 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  38.23 
 
 		 815 aa  344  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  36.64 
 
 		 813 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  33.55 
 
 		 732 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  35.13 
 
 		 723 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  36.5 
 
 		 738 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.85 
 
 		 815 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.7 
 
 		 768 aa  342  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.38 
 
 		 746 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.11 
 
 		 746 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  33.39 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.76 
 
 		 739 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.27 
 
 		 739 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.27 
 
 		 739 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  39.07 
 
 		 815 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  29.15 
 
 		 780 aa  337  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  33.44 
 
 		 732 aa  337  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.41 
 
 		 725 aa  336  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  36.36 
 
 		 821 aa  336  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  33.07 
 
 		 732 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  33.28 
 
 		 732 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  33.28 
 
 		 732 aa  336  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  35.06 
 
 		 733 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 		 743 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  33.28 
 
 		 732 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  33.28 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  32.7 
 
 		 731 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  35.8 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  32.91 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.83 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  33.28 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  35.8 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.56 
 
 		 802 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  34.87 
 
 		 660 aa  334  3e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  31.8 
 
 		 732 aa  334  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  35.8 
 
 		 732 aa  334  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>