More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0791 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  62.12 
 
 
387 aa  472  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  36.64 
 
 
499 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  36.46 
 
 
374 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  38.08 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
450 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  37.1 
 
 
374 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  35.36 
 
 
449 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  36.44 
 
 
451 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  36.63 
 
 
449 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  36.44 
 
 
449 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  36.63 
 
 
449 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  36.15 
 
 
451 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  36.15 
 
 
449 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  35.07 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  36.49 
 
 
443 aa  215  8e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  37.76 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  34.32 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  35.71 
 
 
426 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  38.05 
 
 
439 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  30.03 
 
 
623 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  30.18 
 
 
453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  29.74 
 
 
716 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3236  excinuclease ABC subunit B  25.21 
 
 
665 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  26.56 
 
 
673 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  24.38 
 
 
678 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21171  excinuclease ABC subunit B  24.38 
 
 
678 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  24.79 
 
 
679 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  22.44 
 
 
636 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  22.98 
 
 
666 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17751  excinuclease ABC subunit B  24.38 
 
 
679 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.48 
 
 
679 aa  55.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5213  excinuclease ABC subunit B  22.63 
 
 
665 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1271  excinuclease ABC subunit B  22.73 
 
 
673 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000921929  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  25.62 
 
 
665 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.42 
 
 
719 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  22.92 
 
 
1167 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  24.5 
 
 
674 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000186158  hitchhiker  0.0000000163265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  25.31 
 
 
658 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5671  excinuclease ABC subunit B  25.31 
 
 
658 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  25 
 
 
1126 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1767  excinuclease ABC subunit B  27.78 
 
 
665 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  23.29 
 
 
662 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl058  excinuclease ABC subunit B  23.67 
 
 
615 aa  52.8  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  35.29 
 
 
679 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.27 
 
 
1167 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  27.78 
 
 
738 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  22.89 
 
 
667 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  22.89 
 
 
662 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1226  excinuclease ABC, B subunit  30.28 
 
 
657 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.56679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  22.89 
 
 
667 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3710  excinuclease ABC subunit B  25.61 
 
 
658 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.343081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.73 
 
 
876 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  23.36 
 
 
673 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1509  excinuclease ABC subunit B  23.55 
 
 
670 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00045733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  21.57 
 
 
790 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4959  excinuclease ABC subunit B  24.18 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5329  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0925  excinuclease ABC subunit B  22.73 
 
 
673 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00407979  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  22.62 
 
 
733 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0921  excinuclease ABC, B subunit  30.39 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2438  excinuclease ABC subunit B  22.54 
 
 
670 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.020301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2956  excinuclease ABC subunit B  23.55 
 
 
670 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5252  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5286  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
658 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  25.2 
 
 
661 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  24.4 
 
 
661 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0773  excinuclease ABC subunit B  27.18 
 
 
665 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0247007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  25.2 
 
 
661 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  23.77 
 
 
669 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  25.53 
 
 
922 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  23.46 
 
 
673 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  25.51 
 
 
1178 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 
1165 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1317  excinuclease ABC subunit B  23.14 
 
 
670 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000155227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3030  excinuclease ABC subunit B  22.31 
 
 
739 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00520932  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3066  excinuclease ABC subunit B  24.6 
 
 
672 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000537997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  25.36 
 
 
801 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  33.33 
 
 
676 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1873  excinuclease ABC subunit B  32.35 
 
 
676 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 
726 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  27.2 
 
 
815 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2554  excinuclease ABC subunit B  32.08 
 
 
671 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00351574  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  32.35 
 
 
673 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1554  excinuclease ABC subunit B  23.55 
 
 
705 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0904633  hitchhiker  0.000233414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1416  excinuclease ABC subunit B  24.9 
 
 
664 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.61 
 
 
915 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002950  excinuclease ABC subunit B  31.37 
 
 
676 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000433983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1990  excinuclease ABC subunit B  31.37 
 
 
670 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2046  excinuclease ABC subunit B  32.08 
 
 
675 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0834  excinuclease ABC subunit B  22.31 
 
 
673 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  32.32 
 
 
804 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0948  excinuclease ABC subunit B  22.31 
 
 
673 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00408059  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20100  excinuclease ABC subunit B  30.39 
 
 
669 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0862  excinuclease ABC subunit B  22.31 
 
 
673 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00114313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>