195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2005 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 726 aa  1502    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  47.74 
 
 		 741 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  37.77 
 
 		 744 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  35.63 
 
 		 729 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  32.89 
 
 		 775 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  34.42 
 
 		 764 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  33.14 
 
 		 736 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  32.39 
 
 		 763 aa  266  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  29.55 
 
 		 917 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  28.76 
 
 		 795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.49 
 
 		 741 aa  196  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  28.22 
 
 		 750 aa  190  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 781 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  27.49 
 
 		 779 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.1 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  28.82 
 
 		 804 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  27.57 
 
 		 762 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.31 
 
 		 750 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  29.98 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 1027 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 		 801 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.44 
 
 		 791 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 811 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  29.36 
 
 		 888 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  30.19 
 
 		 888 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.62 
 
 		 899 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 		 944 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  27.83 
 
 		 922 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.12 
 
 		 905 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  24.18 
 
 		 823 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  24.48 
 
 		 778 aa  104  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.27 
 
 		 837 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  28.3 
 
 		 883 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.25 
 
 		 566 aa  103  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  28.87 
 
 		 888 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  28.92 
 
 		 799 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.72 
 
 		 885 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  24.52 
 
 		 912 aa  97.4  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  23.99 
 
 		 901 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.7 
 
 		 800 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 921 aa  95.9  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 929 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  24.78 
 
 		 860 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.38 
 
 		 801 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  25.99 
 
 		 739 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.8 
 
 		 892 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  26.26 
 
 		 892 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 876 aa  92  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  27.11 
 
 		 871 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  24.86 
 
 		 897 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.08 
 
 		 834 aa  90.1  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 651 aa  90.5  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.05 
 
 		 850 aa  90.5  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 829 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  22.59 
 
 		 832 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  26.01 
 
 		 594 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.43 
 
 		 751 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  22.49 
 
 		 721 aa  88.2  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  23.89 
 
 		 857 aa  87.8  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  25.9 
 
 		 800 aa  87.4  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 827 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  24.08 
 
 		 933 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  23.95 
 
 		 860 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  22.81 
 
 		 854 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  24.22 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.77 
 
 		 906 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  23.7 
 
 		 881 aa  85.5  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 		 871 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.3 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.9 
 
 		 885 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  23.65 
 
 		 948 aa  85.1  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  24.93 
 
 		 887 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  25.25 
 
 		 879 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  26.93 
 
 		 904 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.33 
 
 		 1540 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.08 
 
 		 970 aa  84  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 724 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  24.73 
 
 		 783 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 780 aa  82  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.69 
 
 		 807 aa  82  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 		 907 aa  80.9  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  25.34 
 
 		 854 aa  80.5  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  21.61 
 
 		 728 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  23.96 
 
 		 821 aa  80.1  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  24.45 
 
 		 899 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.94 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.95 
 
 		 836 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 887 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.84 
 
 		 740 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  27.97 
 
 		 781 aa  78.2  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.36 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.37 
 
 		 752 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  30.94 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 776 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 919 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 		 732 aa  77  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  24.59 
 
 		 868 aa  75.1  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.42 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>