153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2518 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  100 
 
 		 781 aa  1613    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  36.19 
 
 		 730 aa  467  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.81 
 
 		 776 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  25.92 
 
 		 822 aa  210  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.83 
 
 		 721 aa  202  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.76 
 
 		 821 aa  200  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 		 765 aa  200  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 		 800 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  30.15 
 
 		 858 aa  197  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  27.7 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  27.63 
 
 		 807 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  25.76 
 
 		 772 aa  190  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  33.93 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  27.19 
 
 		 778 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 		 731 aa  181  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 783 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 804 aa  177  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  29.59 
 
 		 739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26 
 
 		 820 aa  170  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.32 
 
 		 834 aa  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 745 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.27 
 
 		 733 aa  167  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  25.55 
 
 		 904 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  26.04 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.82 
 
 		 692 aa  165  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.77 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 722 aa  164  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.7 
 
 		 751 aa  162  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  32.46 
 
 		 661 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.55 
 
 		 752 aa  161  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  27.11 
 
 		 825 aa  160  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  27.15 
 
 		 836 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.14 
 
 		 740 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 829 aa  158  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.23 
 
 		 801 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 732 aa  157  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 792 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.96 
 
 		 717 aa  154  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.35 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 794 aa  152  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.32 
 
 		 744 aa  151  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  28.99 
 
 		 753 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 745 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  28.25 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  28.39 
 
 		 821 aa  148  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  25.29 
 
 		 856 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 		 782 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  25.25 
 
 		 805 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 1078 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.53 
 
 		 1084 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  26.22 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  27.38 
 
 		 759 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.89 
 
 		 824 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.09 
 
 		 651 aa  129  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  24.9 
 
 		 864 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.02 
 
 		 880 aa  103  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  25.82 
 
 		 794 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  24.42 
 
 		 729 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  24.42 
 
 		 747 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.4 
 
 		 737 aa  84  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  28.57 
 
 		 939 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.02 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.1 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.14 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  22.56 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  27.97 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  22.15 
 
 		 794 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  28.63 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.37 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.71 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.91 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.84 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  28.45 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 899 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  25.85 
 
 		 823 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.45 
 
 		 837 aa  65.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  25.87 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  31.15 
 
 		 887 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  25.26 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.02 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.67 
 
 		 906 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  38.14 
 
 		 897 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  32.52 
 
 		 843 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  26.01 
 
 		 783 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.83 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  23.97 
 
 		 316 aa  59.7  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  22.12 
 
 		 854 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  26.41 
 
 		 908 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.6 
 
 		 885 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  33.06 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  25.54 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  22.51 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  26.17 
 
 		 904 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  34.62 
 
 		 929 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  32.61 
 
 		 828 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>