157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1070 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 772 aa  1531    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  40.35 
 
 		 800 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  37.16 
 
 		 804 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  34.25 
 
 		 776 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  40.6 
 
 		 784 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  36.66 
 
 		 765 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  31.29 
 
 		 821 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  33.68 
 
 		 777 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  36.36 
 
 		 778 aa  333  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  32.46 
 
 		 807 aa  325  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  34.65 
 
 		 822 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  31.69 
 
 		 721 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.66 
 
 		 821 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  33.21 
 
 		 800 aa  302  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.48 
 
 		 820 aa  280  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  32.17 
 
 		 836 aa  270  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.25 
 
 		 783 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  29.87 
 
 		 858 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  28.27 
 
 		 856 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  32.45 
 
 		 834 aa  233  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  26.63 
 
 		 864 aa  230  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  32.06 
 
 		 733 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.47 
 
 		 801 aa  210  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  25.81 
 
 		 781 aa  208  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  29.34 
 
 		 730 aa  207  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 724 aa  204  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 829 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.23 
 
 		 751 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.19 
 
 		 825 aa  197  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 		 745 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.85 
 
 		 740 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.78 
 
 		 717 aa  180  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 1078 aa  178  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  25.86 
 
 		 739 aa  177  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.38 
 
 		 732 aa  177  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  26.04 
 
 		 904 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  23.75 
 
 		 745 aa  174  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  25.63 
 
 		 805 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  23.56 
 
 		 782 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  27 
 
 		 667 aa  170  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.42 
 
 		 752 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 731 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.43 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 		 732 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.61 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.27 
 
 		 824 aa  167  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  29.4 
 
 		 753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  22.42 
 
 		 759 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  28.06 
 
 		 1084 aa  162  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  24.9 
 
 		 939 aa  160  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.77 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.19 
 
 		 692 aa  159  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  22.74 
 
 		 722 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  23.97 
 
 		 722 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  22.7 
 
 		 792 aa  150  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  29.86 
 
 		 651 aa  146  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  24.44 
 
 		 661 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 772 aa  144  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  27.86 
 
 		 880 aa  127  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  27.4 
 
 		 729 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  25.68 
 
 		 747 aa  124  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.8 
 
 		 738 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25.06 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  32.04 
 
 		 792 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  22.01 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  27.46 
 
 		 775 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  28.22 
 
 		 794 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.84 
 
 		 783 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  23.05 
 
 		 750 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  30.51 
 
 		 316 aa  92.8  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 		 726 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.1 
 
 		 779 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.82 
 
 		 750 aa  88.2  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.97 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.44 
 
 		 763 aa  84.3  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  20.43 
 
 		 899 aa  84  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  21.35 
 
 		 781 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  21.48 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  19.33 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.54 
 
 		 737 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  21.58 
 
 		 905 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.98 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.79 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  21.74 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.51 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.54 
 
 		 764 aa  72  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  25.37 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  36.36 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  23.47 
 
 		 948 aa  68.2  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  19.81 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 762 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  19.68 
 
 		 883 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  21.78 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  21.02 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  35.29 
 
 		 843 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  20.05 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  30.71 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  20.67 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>