145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3204 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 800 aa  1622    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  37.88 
 
 		 804 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  39.98 
 
 		 772 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  38.64 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  34.74 
 
 		 776 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  36.54 
 
 		 777 aa  416  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  32.45 
 
 		 821 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  33.89 
 
 		 800 aa  347  7e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  32.1 
 
 		 765 aa  332  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.57 
 
 		 821 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  31.92 
 
 		 807 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  32.86 
 
 		 778 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  34.81 
 
 		 836 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  29.86 
 
 		 783 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  32.83 
 
 		 822 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.97 
 
 		 820 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  29.09 
 
 		 858 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.18 
 
 		 721 aa  257  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  28.74 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  27.7 
 
 		 856 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  26.88 
 
 		 864 aa  223  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  25.79 
 
 		 781 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.29 
 
 		 733 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 		 825 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.06 
 
 		 801 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 724 aa  190  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 904 aa  187  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  26.24 
 
 		 740 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.13 
 
 		 824 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  28.42 
 
 		 661 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 745 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.77 
 
 		 692 aa  178  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  24.73 
 
 		 939 aa  178  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.16 
 
 		 794 aa  177  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 		 782 aa  177  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.32 
 
 		 834 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 732 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  31.69 
 
 		 717 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  30.63 
 
 		 667 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.4 
 
 		 753 aa  171  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 722 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 792 aa  169  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 745 aa  167  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 		 744 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.59 
 
 		 751 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 829 aa  165  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.03 
 
 		 724 aa  164  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.35 
 
 		 739 aa  164  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 732 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 728 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  29.71 
 
 		 651 aa  157  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.66 
 
 		 752 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 805 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.1 
 
 		 1084 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  29.25 
 
 		 722 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 1078 aa  149  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 		 772 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.02 
 
 		 880 aa  132  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  23.67 
 
 		 729 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.95 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  23.27 
 
 		 747 aa  104  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.03 
 
 		 794 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.36 
 
 		 792 aa  99.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  21.74 
 
 		 794 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.92 
 
 		 804 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  23.7 
 
 		 741 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.27 
 
 		 316 aa  87.4  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.9 
 
 		 726 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  27.25 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.74 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  21.94 
 
 		 729 aa  80.9  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 763 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.49 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.57 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  23.18 
 
 		 912 aa  77.8  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.21 
 
 		 795 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.58 
 
 		 917 aa  75.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 799 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  20.12 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.05 
 
 		 905 aa  71.2  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  23.5 
 
 		 899 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  23.3 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.33 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  23.16 
 
 		 780 aa  68.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  24.38 
 
 		 843 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  27.37 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  21.04 
 
 		 801 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  22.52 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  22.47 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  24.48 
 
 		 921 aa  64.7  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  21.24 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  21.67 
 
 		 883 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  21.85 
 
 		 779 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  21.33 
 
 		 811 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  22.59 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  25.36 
 
 		 850 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>