101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  56.8 
 
 
745 aa  744    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  64.88 
 
 
792 aa  856    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  58.69 
 
 
722 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
661 aa  1345    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  49.17 
 
 
744 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  49.56 
 
 
752 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  48.5 
 
 
782 aa  538  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  48.21 
 
 
740 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  47.39 
 
 
717 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 
731 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  46.72 
 
 
745 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  43.59 
 
 
739 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
728 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  45.97 
 
 
732 aa  485  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  44.48 
 
 
722 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  41.98 
 
 
753 aa  445  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  44.73 
 
 
732 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  44.15 
 
 
667 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.47 
 
 
692 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.56 
 
 
794 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.41 
 
 
724 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  34.39 
 
 
825 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
829 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.65 
 
 
824 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
1078 aa  300  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  35.65 
 
 
1084 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  32.69 
 
 
904 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.07 
 
 
751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
772 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.21 
 
 
801 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  32.88 
 
 
759 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.91 
 
 
834 aa  246  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  34.43 
 
 
729 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  28.42 
 
 
800 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  31.26 
 
 
800 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  33.55 
 
 
858 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  31.89 
 
 
784 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  35.8 
 
 
747 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.72 
 
 
836 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  25.31 
 
 
765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.5 
 
 
821 aa  165  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.37 
 
 
730 aa  165  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  30.07 
 
 
822 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  32.46 
 
 
781 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  29.81 
 
 
777 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 
804 aa  158  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.11 
 
 
776 aa  158  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.69 
 
 
820 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 
778 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  28.85 
 
 
807 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  26.72 
 
 
783 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.78 
 
 
724 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  24.44 
 
 
772 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  29.98 
 
 
821 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  27.47 
 
 
864 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  27.74 
 
 
721 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 
651 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.14 
 
 
733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  30.39 
 
 
856 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  27.7 
 
 
805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 
880 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.82 
 
 
794 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.79 
 
 
792 aa  107  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 
794 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.11 
 
 
738 aa  100  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  22.67 
 
 
750 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  21.11 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.1 
 
 
737 aa  72.4  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  28.57 
 
 
939 aa  71.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 
762 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.65 
 
 
726 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  24.78 
 
 
804 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 
783 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 
1027 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.3 
 
 
775 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
729 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  21.51 
 
 
741 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 
779 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
781 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.39 
 
 
750 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  25.77 
 
 
801 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.61 
 
 
795 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  25.28 
 
 
933 aa  54.3  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  21.51 
 
 
736 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.87 
 
 
799 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.94 
 
 
908 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  22.36 
 
 
763 aa  52.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.58 
 
 
809 aa  50.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 
744 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.18 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  25.35 
 
 
1495 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 
1502 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 
929 aa  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.63 
 
 
729 aa  47.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  27.78 
 
 
316 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 
780 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  22.39 
 
 
914 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  31.95 
 
 
899 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  28.78 
 
 
908 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  34.34 
 
 
905 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>