186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1290 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 795 aa  1628    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  38.32 
 
 		 783 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  37.1 
 
 		 779 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 781 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  38.65 
 
 		 791 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 		 750 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  31.49 
 
 		 741 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 1027 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  28.92 
 
 		 811 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.86 
 
 		 801 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  28.42 
 
 		 726 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 729 aa  196  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  27.08 
 
 		 762 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.93 
 
 		 775 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  27.87 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.94 
 
 		 729 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 737 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 764 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.58 
 
 		 744 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.37 
 
 		 917 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  28.47 
 
 		 899 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  33.63 
 
 		 763 aa  148  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.51 
 
 		 736 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.54 
 
 		 750 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  31.17 
 
 		 823 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  30.63 
 
 		 888 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.69 
 
 		 905 aa  134  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  31.32 
 
 		 888 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  30.79 
 
 		 888 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  32.27 
 
 		 887 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  31.66 
 
 		 922 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  31.02 
 
 		 860 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  27.04 
 
 		 883 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.92 
 
 		 927 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  31.97 
 
 		 901 aa  111  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.59 
 
 		 854 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  29.16 
 
 		 929 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  29.5 
 
 		 944 aa  107  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30 
 
 		 885 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 		 854 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  25.08 
 
 		 912 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 		 594 aa  104  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.46 
 
 		 944 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.23 
 
 		 892 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 		 892 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.98 
 
 		 962 aa  101  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  26.55 
 
 		 899 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.02 
 
 		 970 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.98 
 
 		 837 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  28.01 
 
 		 921 aa  97.4  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.4 
 
 		 948 aa  97.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  27.64 
 
 		 908 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.21 
 
 		 778 aa  95.1  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22.6 
 
 		 800 aa  94.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  28.24 
 
 		 919 aa  94.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  26.07 
 
 		 907 aa  94.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 832 aa  94.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  29.02 
 
 		 933 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 651 aa  92  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  28.23 
 
 		 860 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  27.92 
 
 		 906 aa  92  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  29.4 
 
 		 879 aa  91.3  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.69 
 
 		 1540 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  26.86 
 
 		 904 aa  90.1  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.99 
 
 		 897 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.88 
 
 		 971 aa  88.6  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 		 968 aa  88.2  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  27.84 
 
 		 871 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.56 
 
 		 920 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  29.2 
 
 		 871 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  29.04 
 
 		 965 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 799 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 		 827 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.77 
 
 		 836 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  25.88 
 
 		 915 aa  82  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  26.98 
 
 		 912 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.58 
 
 		 724 aa  81.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 		 897 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  22.19 
 
 		 834 aa  81.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  28.61 
 
 		 897 aa  80.1  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.25 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 876 aa  79  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  26.06 
 
 		 783 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  23.21 
 
 		 800 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  27.4 
 
 		 873 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  23.23 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  20.8 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  42.86 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 899 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.81 
 
 		 792 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  28.85 
 
 		 943 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.56 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  23.12 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.75 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>