138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1451 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  100 
 
 		 864 aa  1754    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  46.7 
 
 		 856 aa  697    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  34.68 
 
 		 939 aa  411  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 		 800 aa  278  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  29.14 
 
 		 778 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  31.41 
 
 		 821 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  27.63 
 
 		 822 aa  250  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  27.86 
 
 		 807 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.9 
 
 		 820 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  27.35 
 
 		 784 aa  229  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.69 
 
 		 821 aa  228  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  27.17 
 
 		 800 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.17 
 
 		 776 aa  221  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  30.61 
 
 		 858 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  26.63 
 
 		 772 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  27.95 
 
 		 721 aa  213  9e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.28 
 
 		 783 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  28.97 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 		 777 aa  208  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  25.04 
 
 		 765 aa  204  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.19 
 
 		 836 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.21 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.87 
 
 		 724 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.87 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.92 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 731 aa  171  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  30.16 
 
 		 732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  32.49 
 
 		 825 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.81 
 
 		 692 aa  163  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.47 
 
 		 824 aa  163  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  25.98 
 
 		 834 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  27.53 
 
 		 904 aa  158  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  31.62 
 
 		 667 aa  157  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 		 722 aa  156  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  28.6 
 
 		 801 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 829 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 782 aa  146  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 740 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.77 
 
 		 752 aa  144  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 745 aa  144  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 794 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 728 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.77 
 
 		 739 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.89 
 
 		 717 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  29.98 
 
 		 745 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.76 
 
 		 751 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.08 
 
 		 744 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  28.45 
 
 		 722 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 732 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 1078 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  27.92 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  28.39 
 
 		 759 aa  131  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.77 
 
 		 730 aa  117  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 805 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  24.9 
 
 		 781 aa  115  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  28.07 
 
 		 747 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 651 aa  90.9  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  21.28 
 
 		 750 aa  88.6  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.47 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.54 
 
 		 737 aa  85.5  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  25.5 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25 
 
 		 792 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  33.03 
 
 		 1084 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  20.68 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 779 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.23 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  24.56 
 
 		 907 aa  72.4  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 1027 aa  72  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  23.07 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  26.28 
 
 		 919 aa  71.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  24.32 
 
 		 783 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.27 
 
 		 738 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  26.56 
 
 		 859 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  22.59 
 
 		 794 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  21.85 
 
 		 736 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  36.8 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  23.13 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.03 
 
 		 744 aa  65.1  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  22.63 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  28.66 
 
 		 843 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  20.71 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  25.36 
 
 		 933 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  21.53 
 
 		 804 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  27.92 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  21.98 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.25 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  23.72 
 
 		 899 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.47 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  21.24 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.32 
 
 		 906 aa  57.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.57 
 
 		 905 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.24 
 
 		 917 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.25 
 
 		 948 aa  57  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  22.95 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 		 860 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  23.1 
 
 		 763 aa  55.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  23.15 
 
 		 794 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>