60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1171 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  647    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  30.15 
 
 		 800 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.62 
 
 		 820 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  28.93 
 
 		 804 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  30.26 
 
 		 858 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  28.27 
 
 		 778 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  27.53 
 
 		 856 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.65 
 
 		 821 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  26.73 
 
 		 821 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  27.7 
 
 		 784 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  30.03 
 
 		 772 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  24.27 
 
 		 800 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.97 
 
 		 733 aa  86.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  28.66 
 
 		 807 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  25.88 
 
 		 822 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 776 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.41 
 
 		 721 aa  79.7  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  27.41 
 
 		 765 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  25.57 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.61 
 
 		 801 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.84 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 		 904 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.89 
 
 		 825 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  23.97 
 
 		 781 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  22.44 
 
 		 939 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  27.04 
 
 		 740 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  26.25 
 
 		 864 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.66 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.29 
 
 		 752 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 794 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.71 
 
 		 824 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 722 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  25.16 
 
 		 739 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  24.2 
 
 		 834 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  23.9 
 
 		 805 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 745 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.34 
 
 		 751 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.83 
 
 		 724 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.88 
 
 		 651 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  25.61 
 
 		 1084 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 		 772 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  25 
 
 		 722 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 729 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 661 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.41 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  22.19 
 
 		 829 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  27.75 
 
 		 667 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 753 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.78 
 
 		 692 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 731 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.15 
 
 		 779 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 745 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  24.34 
 
 		 783 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 781 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>