98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3970 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  64.88 
 
 
661 aa  857    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  58.21 
 
 
722 aa  770    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
792 aa  1609    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  52.83 
 
 
745 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  47.42 
 
 
752 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  46.34 
 
 
744 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  46.3 
 
 
782 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  46.23 
 
 
740 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  44.74 
 
 
717 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
731 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 
745 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  40.66 
 
 
739 aa  512  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 
722 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
728 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  43.78 
 
 
732 aa  475  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  41.15 
 
 
753 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  43.48 
 
 
667 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.32 
 
 
692 aa  405  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.31 
 
 
794 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  38.71 
 
 
724 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  34.75 
 
 
825 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
1078 aa  349  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.71 
 
 
824 aa  346  8e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  32.87 
 
 
904 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 
829 aa  336  7.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  36.43 
 
 
1084 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
772 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.03 
 
 
751 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  31.63 
 
 
801 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.57 
 
 
834 aa  275  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  33.07 
 
 
759 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.73 
 
 
821 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 
778 aa  178  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  26 
 
 
800 aa  177  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  30.37 
 
 
822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.03 
 
 
836 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  24.92 
 
 
800 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  29.65 
 
 
784 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  23.42 
 
 
765 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  28.69 
 
 
858 aa  160  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  25.68 
 
 
807 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  30.19 
 
 
777 aa  158  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  26.19 
 
 
804 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  30.68 
 
 
776 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  33.73 
 
 
781 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  29.92 
 
 
821 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  34.06 
 
 
747 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  30 
 
 
729 aa  151  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  29.04 
 
 
730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 
651 aa  146  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.96 
 
 
820 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  31.23 
 
 
805 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.21 
 
 
721 aa  138  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  25.36 
 
 
772 aa  138  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  28.69 
 
 
864 aa  137  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  29.33 
 
 
783 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  28.91 
 
 
856 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.64 
 
 
724 aa  136  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28 
 
 
733 aa  132  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  26.11 
 
 
794 aa  124  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.24 
 
 
880 aa  115  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 
794 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.31 
 
 
792 aa  92.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  20.7 
 
 
738 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.2 
 
 
762 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  22.24 
 
 
750 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  25 
 
 
939 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  21.17 
 
 
741 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.39 
 
 
736 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.76 
 
 
737 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.03 
 
 
741 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  23.46 
 
 
804 aa  64.3  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  22.28 
 
 
779 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.53 
 
 
726 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.68 
 
 
795 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
1027 aa  61.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  21.54 
 
 
744 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  26.87 
 
 
729 aa  61.2  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.15 
 
 
750 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 
775 aa  60.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.08 
 
 
801 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  24.24 
 
 
763 aa  57.4  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  22.61 
 
 
781 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  23.75 
 
 
729 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24 
 
 
488 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.23 
 
 
316 aa  52.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.44 
 
 
783 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2725  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 
582 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 
905 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.05 
 
 
799 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.38 
 
 
492 aa  47.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 
811 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  22.69 
 
 
860 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  26.25 
 
 
484 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  23.35 
 
 
832 aa  44.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  21.76 
 
 
827 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>