146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2428 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  47.61 
 
 
821 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
858 aa  1755    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  33.72 
 
 
821 aa  369  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  34.68 
 
 
804 aa  351  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  30.51 
 
 
778 aa  330  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  30.38 
 
 
784 aa  323  9.000000000000001e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 
800 aa  316  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  31.8 
 
 
776 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  31.7 
 
 
800 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 
807 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  29.24 
 
 
822 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 
836 aa  298  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.62 
 
 
820 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 
777 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  29 
 
 
765 aa  258  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  30.98 
 
 
864 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 
772 aa  240  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  31.81 
 
 
856 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.35 
 
 
834 aa  211  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  28.53 
 
 
781 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  28.41 
 
 
721 aa  209  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.29 
 
 
783 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  29.4 
 
 
739 aa  197  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
745 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.61 
 
 
801 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  33.55 
 
 
661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  28.02 
 
 
939 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  32.29 
 
 
753 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.77 
 
 
717 aa  181  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  31.89 
 
 
825 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 
829 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.27 
 
 
744 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.3 
 
 
824 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34 
 
 
724 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.27 
 
 
740 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  33.04 
 
 
732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
792 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  26.46 
 
 
904 aa  174  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
745 aa  170  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
722 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
731 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
732 aa  168  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  28.99 
 
 
730 aa  168  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.68 
 
 
751 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  34.07 
 
 
733 aa  162  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.79 
 
 
752 aa  161  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  31.07 
 
 
722 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
782 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.25 
 
 
794 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  31.35 
 
 
667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.25 
 
 
724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
1078 aa  147  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.02 
 
 
692 aa  146  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
772 aa  140  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.89 
 
 
1084 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  25.15 
 
 
759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 
880 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  26.6 
 
 
805 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  30.84 
 
 
316 aa  122  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  27.51 
 
 
747 aa  110  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  26.11 
 
 
729 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.19 
 
 
651 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.44 
 
 
792 aa  99.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.06 
 
 
738 aa  96.3  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.8 
 
 
737 aa  92  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  23.4 
 
 
794 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  22.86 
 
 
794 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 
763 aa  78.2  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.45 
 
 
762 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 
1027 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  26.12 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.16 
 
 
741 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  22.79 
 
 
750 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.06 
 
 
775 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.67 
 
 
750 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.43 
 
 
795 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 
899 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 
811 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.85 
 
 
726 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 
566 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
729 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 
804 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 
905 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  28.17 
 
 
850 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 
801 aa  61.6  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.6 
 
 
837 aa  61.6  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.88 
 
 
783 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.71 
 
 
744 aa  60.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  23.75 
 
 
888 aa  61.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 
888 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 
860 aa  60.1  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  22.64 
 
 
888 aa  58.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.8 
 
 
492 aa  57.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.09 
 
 
779 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.82 
 
 
971 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.19 
 
 
736 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  23.06 
 
 
927 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.12 
 
 
948 aa  55.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.33 
 
 
741 aa  54.3  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>