160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1021 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  100 
 
 		 721 aa  1457    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  31.47 
 
 		 772 aa  295  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  30.71 
 
 		 804 aa  293  7e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  30.7 
 
 		 800 aa  281  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  30.31 
 
 		 784 aa  270  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  32.11 
 
 		 778 aa  261  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  29.18 
 
 		 800 aa  257  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  28.97 
 
 		 777 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  29.76 
 
 		 807 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  28.74 
 
 		 765 aa  243  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 821 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.68 
 
 		 821 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  29.18 
 
 		 822 aa  218  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.82 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  27.95 
 
 		 864 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  27.4 
 
 		 856 aa  210  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  26.83 
 
 		 781 aa  202  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  28.75 
 
 		 858 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.37 
 
 		 836 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.84 
 
 		 820 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.36 
 
 		 834 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.85 
 
 		 801 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.13 
 
 		 740 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  31.58 
 
 		 825 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  33.92 
 
 		 904 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 		 753 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.43 
 
 		 739 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 724 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.15 
 
 		 724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.93 
 
 		 733 aa  165  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 745 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.49 
 
 		 824 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 829 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 732 aa  156  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 745 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.24 
 
 		 751 aa  154  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 		 731 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.21 
 
 		 692 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 667 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.65 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  27.29 
 
 		 728 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 722 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 794 aa  147  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 772 aa  147  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  33.84 
 
 		 717 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  25.49 
 
 		 1084 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 1078 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  29.71 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 		 792 aa  138  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.26 
 
 		 752 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  27.74 
 
 		 661 aa  132  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 782 aa  130  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  26.26 
 
 		 759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  24.81 
 
 		 805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.57 
 
 		 763 aa  112  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.86 
 
 		 762 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  22.28 
 
 		 729 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  23.36 
 
 		 747 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.35 
 
 		 741 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.28 
 
 		 750 aa  90.9  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  33 
 
 		 939 aa  90.9  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  22.49 
 
 		 726 aa  88.2  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.37 
 
 		 741 aa  87.4  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.55 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.86 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.41 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.65 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.08 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.78 
 
 		 880 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  26.06 
 
 		 850 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.09 
 
 		 764 aa  76.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.51 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.92 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  25.46 
 
 		 794 aa  74.3  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  21.87 
 
 		 781 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.55 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  24.65 
 
 		 779 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.36 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  23.82 
 
 		 566 aa  70.5  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.36 
 
 		 917 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 907 aa  67.8  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  27.75 
 
 		 548 aa  66.6  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  23.14 
 
 		 804 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.15 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  20.89 
 
 		 927 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  22.75 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  21.04 
 
 		 811 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.01 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.83 
 
 		 899 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  22.16 
 
 		 908 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  25.56 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  21.43 
 
 		 912 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  20.3 
 
 		 887 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>