122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0239 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 772 aa  1543    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  51.9 
 
 		 1078 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  51.81 
 
 		 1084 aa  649    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.86 
 
 		 724 aa  356  7.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 		 731 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  36.52 
 
 		 717 aa  350  8e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 728 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  35.83 
 
 		 753 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 732 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 792 aa  334  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.14 
 
 		 794 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  37.03 
 
 		 740 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  36.59 
 
 		 732 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  35.99 
 
 		 782 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  38.32 
 
 		 722 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 722 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  34.58 
 
 		 667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  40.43 
 
 		 752 aa  303  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.55 
 
 		 751 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  34.99 
 
 		 745 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  32.26 
 
 		 739 aa  292  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.07 
 
 		 744 aa  290  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.07 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  31.77 
 
 		 825 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  34.86 
 
 		 661 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.75 
 
 		 824 aa  273  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 829 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  31.55 
 
 		 904 aa  263  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  32.97 
 
 		 759 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  27.63 
 
 		 834 aa  244  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  28.66 
 
 		 801 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  30.11 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  33.12 
 
 		 776 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  31.2 
 
 		 784 aa  173  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  24.89 
 
 		 800 aa  170  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  32.58 
 
 		 777 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  26.13 
 
 		 778 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  26.4 
 
 		 822 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 804 aa  163  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.76 
 
 		 820 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 		 807 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.37 
 
 		 721 aa  160  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  30.47 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  31.4 
 
 		 821 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  30.56 
 
 		 800 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  33.5 
 
 		 783 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.33 
 
 		 836 aa  151  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  28.29 
 
 		 781 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.71 
 
 		 733 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  31.43 
 
 		 864 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.73 
 
 		 821 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 772 aa  144  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 724 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  31.64 
 
 		 858 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  22.55 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  29.8 
 
 		 856 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  22.91 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  30.14 
 
 		 805 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  20.63 
 
 		 880 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  23.63 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.28 
 
 		 794 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  27.41 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.89 
 
 		 736 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  28.49 
 
 		 850 aa  76.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  23.94 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  19.48 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  22.28 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25.6 
 
 		 779 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  39.33 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  18.8 
 
 		 738 aa  72  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  23.05 
 
 		 794 aa  72  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 781 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 1027 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  35.87 
 
 		 939 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.14 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  23.93 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  35.71 
 
 		 905 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.46 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  26.4 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  40.78 
 
 		 899 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.35 
 
 		 775 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  27.75 
 
 		 873 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.1 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.29 
 
 		 316 aa  56.6  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  34.19 
 
 		 933 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 		 744 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  29.03 
 
 		 904 aa  51.6  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  21.64 
 
 		 548 aa  51.2  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 917 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  41.33 
 
 		 897 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  28.85 
 
 		 843 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.33 
 
 		 488 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  25.26 
 
 		 933 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>