139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3933 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 805 aa  1667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 730 aa  179  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.03 
 
 		 778 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.96 
 
 		 834 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.51 
 
 		 820 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 		 777 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 800 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  23.05 
 
 		 765 aa  156  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.34 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 801 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.12 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  26.95 
 
 		 740 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 904 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  24.3 
 
 		 772 aa  148  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  27.22 
 
 		 804 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 		 776 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  25.25 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.91 
 
 		 717 aa  141  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 722 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 		 792 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  23.09 
 
 		 784 aa  140  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 		 782 aa  140  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 728 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  27.65 
 
 		 821 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.53 
 
 		 800 aa  135  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 		 829 aa  135  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 		 753 aa  134  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.38 
 
 		 821 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 731 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.33 
 
 		 739 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  29.26 
 
 		 825 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.34 
 
 		 651 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  27.49 
 
 		 822 aa  129  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.21 
 
 		 732 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  24.23 
 
 		 856 aa  128  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.41 
 
 		 807 aa  128  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 745 aa  124  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.81 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 745 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.09 
 
 		 752 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.97 
 
 		 724 aa  120  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  26.37 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.92 
 
 		 751 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.4 
 
 		 824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  27.71 
 
 		 667 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 		 783 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 794 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  27.7 
 
 		 661 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.16 
 
 		 744 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 858 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  27.03 
 
 		 759 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.74 
 
 		 836 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  25.06 
 
 		 864 aa  108  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 1078 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.97 
 
 		 692 aa  107  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.53 
 
 		 1084 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 772 aa  96.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  26.8 
 
 		 794 aa  95.9  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.67 
 
 		 880 aa  92.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.83 
 
 		 775 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  23.67 
 
 		 939 aa  88.2  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.61 
 
 		 729 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.53 
 
 		 736 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  25.45 
 
 		 729 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  23.12 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  26.5 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.3 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.73 
 
 		 738 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.34 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.31 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.65 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25.6 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  23.08 
 
 		 912 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  24.85 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  24.09 
 
 		 899 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.33 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  22.91 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 		 899 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  30.99 
 
 		 885 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 919 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  31.97 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 783 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.2 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 780 aa  60.8  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 906 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 887 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 887 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.15 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  21.8 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.47 
 
 		 850 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  24.17 
 
 		 921 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26 
 
 		 779 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 873 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  26.09 
 
 		 828 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.04 
 
 		 799 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  23.06 
 
 		 907 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>