243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1141 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  100 
 
 		 492 aa  1003    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  30.59 
 
 		 548 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  32.73 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  34.67 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.3 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  33.72 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  27.66 
 
 		 850 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.49 
 
 		 741 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.78 
 
 		 799 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  30.45 
 
 		 762 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  27.39 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.66 
 
 		 763 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  26.85 
 
 		 729 aa  97.1  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 		 750 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.27 
 
 		 733 aa  93.2  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  25.12 
 
 		 859 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.09 
 
 		 737 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  27.51 
 
 		 795 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.61 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.34 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.72 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.3 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  26.15 
 
 		 781 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  26.8 
 
 		 729 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  26.95 
 
 		 823 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.95 
 
 		 775 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.05 
 
 		 736 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.08 
 
 		 750 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.43 
 
 		 744 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  27.51 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 722 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.77 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 800 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  39.64 
 
 		 780 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  23.53 
 
 		 777 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  26.21 
 
 		 822 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 		 765 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  23.66 
 
 		 783 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  23.06 
 
 		 778 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  23.31 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.53 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.31 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 916 aa  72  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  24.61 
 
 		 794 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.45 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 		 1027 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  25.23 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 		 825 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  22.45 
 
 		 857 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  24.61 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.94 
 
 		 1540 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.77 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 917 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  28.02 
 
 		 948 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.56 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.18 
 
 		 854 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  24.04 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  24.43 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  22.81 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 772 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 929 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 829 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  23.15 
 
 		 794 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.12 
 
 		 821 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.26 
 
 		 880 aa  63.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  20.37 
 
 		 778 aa  63.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.81 
 
 		 905 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  23.08 
 
 		 888 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  38.61 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  26.43 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  28.35 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 904 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.99 
 
 		 811 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 		 899 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.5 
 
 		 890 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.39 
 
 		 801 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.49 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  22.58 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  23.19 
 
 		 892 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  33.08 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  26.22 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  26.64 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  22.08 
 
 		 907 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  22.33 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  21.22 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 832 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  28.88 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  23.57 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.89 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  25.29 
 
 		 834 aa  57.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 		 912 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>