296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3123 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  100 
 
 		 843 aa  1737    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  42.81 
 
 		 780 aa  625  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  39.59 
 
 		 828 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  36.97 
 
 		 873 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5312  hypothetical protein  32.28 
 
 		 625 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  25.76 
 
 		 933 aa  128  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.43 
 
 		 967 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0051  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.56 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4850  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  23.56 
 
 		 1096 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.829455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  22.87 
 
 		 1209 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3147  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.72 
 
 		 893 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  24.09 
 
 		 914 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  25.84 
 
 		 783 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  24.78 
 
 		 765 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  42.5 
 
 		 799 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  28.63 
 
 		 905 aa  80.9  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  23.13 
 
 		 859 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 778 aa  79  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.05 
 
 		 850 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  23.27 
 
 		 899 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 1027 aa  75.1  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.2 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 		 548 aa  72.4  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.87 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.18 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 854 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  23.82 
 
 		 881 aa  72  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  23.87 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.86 
 
 		 885 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  22.54 
 
 		 860 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 729 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  29.27 
 
 		 811 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  32.79 
 
 		 883 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  32.77 
 
 		 922 aa  67.4  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  23.64 
 
 		 860 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  32.56 
 
 		 944 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  35.4 
 
 		 879 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  24.38 
 
 		 800 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  30 
 
 		 929 aa  67.4  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.03 
 
 		 944 aa  67  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.41 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  32.31 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  38.74 
 
 		 854 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  28.44 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  22.09 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  37.5 
 
 		 921 aa  65.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  31.93 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  31.93 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  21.32 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  36.28 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  34.95 
 
 		 948 aa  65.1  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  37.25 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  32.71 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  26.52 
 
 		 901 aa  64.7  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  29.41 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  22 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  27.84 
 
 		 864 aa  64.3  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  30.25 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  25.33 
 
 		 784 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  28.93 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  40.91 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30.97 
 
 		 779 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.67 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  31.09 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 		 801 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  32.5 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  30 
 
 		 832 aa  62.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 		 732 aa  62.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  33.88 
 
 		 837 aa  62  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  31.97 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  38.61 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  25.39 
 
 		 834 aa  61.6  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 762 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 778 aa  60.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  32.71 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  29.38 
 
 		 887 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.81 
 
 		 783 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  32.52 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  34.51 
 
 		 907 aa  60.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  29.38 
 
 		 887 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.19 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  32.23 
 
 		 871 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  34.26 
 
 		 943 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.83 
 
 		 971 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  32.35 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  35.82 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.62 
 
 		 885 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.19 
 
 		 962 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.42 
 
 		 920 aa  58.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.4 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  34.55 
 
 		 777 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.92 
 
 		 892 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  31.3 
 
 		 904 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>