149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1586 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1718    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  36.21 
 
 		 888 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  36.32 
 
 		 888 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  35.86 
 
 		 888 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  34.8 
 
 		 883 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  30.18 
 
 		 912 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.9 
 
 		 915 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  31.2 
 
 		 921 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  30.81 
 
 		 899 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  30.24 
 
 		 906 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  29.45 
 
 		 904 aa  283  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  30.48 
 
 		 907 aa  267  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.92 
 
 		 897 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.69 
 
 		 905 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  30.23 
 
 		 908 aa  266  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  29.28 
 
 		 887 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  29.28 
 
 		 887 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 		 897 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  29.84 
 
 		 912 aa  259  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.18 
 
 		 920 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  28.14 
 
 		 899 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  28.04 
 
 		 899 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.13 
 
 		 892 aa  251  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  28.34 
 
 		 885 aa  248  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  29.38 
 
 		 854 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  29.62 
 
 		 897 aa  245  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  28.17 
 
 		 944 aa  244  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 		 899 aa  242  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  29.39 
 
 		 887 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 701 aa  234  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.02 
 
 		 854 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.62 
 
 		 948 aa  224  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  28.74 
 
 		 892 aa  224  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  30.33 
 
 		 860 aa  224  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  26.31 
 
 		 860 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 908 aa  217  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  33.98 
 
 		 837 aa  211  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  28.38 
 
 		 927 aa  211  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.1 
 
 		 885 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  28.17 
 
 		 832 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  30.11 
 
 		 879 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.39 
 
 		 971 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  29.1 
 
 		 922 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  26.13 
 
 		 887 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  26.93 
 
 		 871 aa  192  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.71 
 
 		 962 aa  191  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 871 aa  191  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  30.73 
 
 		 901 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  28.42 
 
 		 868 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  34.87 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.48 
 
 		 944 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  26.48 
 
 		 888 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 857 aa  178  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 		 929 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.13 
 
 		 876 aa  174  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.3 
 
 		 1540 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.62 
 
 		 919 aa  172  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 729 aa  172  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.6 
 
 		 970 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  26.71 
 
 		 933 aa  170  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.87 
 
 		 885 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  25.29 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 		 943 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 968 aa  160  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  31.28 
 
 		 456 aa  157  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  27.23 
 
 		 965 aa  154  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  25.72 
 
 		 986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  29.8 
 
 		 737 aa  145  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  30.35 
 
 		 762 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  31.17 
 
 		 795 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  26.65 
 
 		 918 aa  131  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  30.4 
 
 		 750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  32.06 
 
 		 741 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 764 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 763 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 		 781 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.87 
 
 		 783 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.63 
 
 		 779 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.18 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 		 1027 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  27.12 
 
 		 775 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.46 
 
 		 744 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  25.34 
 
 		 778 aa  97.8  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.55 
 
 		 736 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  28.05 
 
 		 811 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.46 
 
 		 804 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  28.41 
 
 		 741 aa  92.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.29 
 
 		 827 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 		 801 aa  91.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 729 aa  91.3  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 917 aa  85.5  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.19 
 
 		 800 aa  83.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 		 807 aa  81.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.95 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  25.36 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.24 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.59 
 
 		 724 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>