235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2649 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 873 aa  1763    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  39.6 
 
 		 828 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  37.26 
 
 		 843 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  40.06 
 
 		 780 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  33.41 
 
 		 933 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.85 
 
 		 967 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4850  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  29.04 
 
 		 1096 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.829455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5312  hypothetical protein  36.41 
 
 		 625 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0051  CRISPR-associated HD domain-containing protein  28.61 
 
 		 921 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  27.21 
 
 		 1209 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3147  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.54 
 
 		 893 aa  87.8  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 737 aa  85.9  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 		 729 aa  84.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.8 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.89 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  23.58 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  35.03 
 
 		 944 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  41.75 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  27.63 
 
 		 795 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.37 
 
 		 763 aa  76.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.76 
 
 		 948 aa  72.4  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  38.98 
 
 		 962 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  34.34 
 
 		 736 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  27.52 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  31.25 
 
 		 832 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  23.61 
 
 		 729 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  26.3 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  23.87 
 
 		 822 aa  68.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.79 
 
 		 762 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  44.21 
 
 		 566 aa  67.4  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  27.3 
 
 		 850 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  31.45 
 
 		 854 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  39.42 
 
 		 943 aa  67  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 		 781 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  35 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  21.48 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.54 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  30.58 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  32.18 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  30.71 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22.31 
 
 		 800 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  37.5 
 
 		 899 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  36.51 
 
 		 919 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  26.44 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  36.44 
 
 		 783 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 		 904 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  23.63 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  42.59 
 
 		 920 aa  62.4  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  36.61 
 
 		 905 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.11 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 1027 aa  62  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  36.45 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.44 
 
 		 825 aa  61.6  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  24.81 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.97 
 
 		 944 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  23.59 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  21.91 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  41.67 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 		 804 aa  60.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  21.83 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 744 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  36.27 
 
 		 922 aa  60.1  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 859 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  28.47 
 
 		 804 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 776 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  27.4 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.39 
 
 		 1540 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  37.5 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  22.13 
 
 		 829 aa  58.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  40.28 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  37.14 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.78 
 
 		 970 aa  57.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  36.63 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.38 
 
 		 724 aa  57.4  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  36.63 
 
 		 888 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 805 aa  57  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  25.85 
 
 		 1162 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  36.73 
 
 		 907 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.62 
 
 		 885 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 854 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  37.37 
 
 		 912 aa  56.2  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.18 
 
 		 836 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  36.61 
 
 		 968 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.04 
 
 		 794 aa  55.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  39.05 
 
 		 912 aa  55.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  28.91 
 
 		 566 aa  55.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.78 
 
 		 753 aa  55.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.52 
 
 		 764 aa  55.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  25.56 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.63 
 
 		 733 aa  55.1  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 		 722 aa  54.3  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  30.61 
 
 		 887 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 		 908 aa  54.3  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  32.99 
 
 		 921 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.77 
 
 		 915 aa  54.3  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>