105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4478 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  100 
 
 		 967 aa  1908    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  36.89 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4850  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  34.04 
 
 		 1096 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.829455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  32.15 
 
 		 1209 aa  270  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0051  CRISPR-associated HD domain-containing protein  30.42 
 
 		 921 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3147  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  28.99 
 
 		 893 aa  176  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  29.52 
 
 		 780 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  30.09 
 
 		 828 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 873 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  28.43 
 
 		 843 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 804 aa  75.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.86 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.77 
 
 		 733 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  20.68 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  26.02 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.42 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 		 899 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  34.82 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30.45 
 
 		 779 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  38.61 
 
 		 795 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  33.1 
 
 		 750 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.37 
 
 		 737 aa  60.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 		 854 aa  59.7  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  35.85 
 
 		 741 aa  59.3  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  27.6 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  31.3 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.23 
 
 		 892 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  30.36 
 
 		 899 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.83 
 
 		 1540 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 948 aa  57.4  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 		 929 aa  56.2  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 		 868 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.33 
 
 		 962 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 		 829 aa  55.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  37 
 
 		 729 aa  55.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  39.45 
 
 		 885 aa  54.7  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  36.17 
 
 		 794 aa  54.7  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  31.9 
 
 		 887 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.68 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  32.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 1027 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  30.17 
 
 		 944 aa  52  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.7 
 
 		 736 aa  51.6  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  35.92 
 
 		 763 aa  51.6  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.88 
 
 		 905 aa  51.6  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 729 aa  51.6  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  29.8 
 
 		 726 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.99 
 
 		 944 aa  50.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  31.22 
 
 		 801 aa  50.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  30.28 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  27.81 
 
 		 566 aa  50.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 860 aa  50.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 827 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 807 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  28.67 
 
 		 965 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 906 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.38 
 
 		 764 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  28.4 
 
 		 912 aa  49.7  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  41.54 
 
 		 762 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  20.09 
 
 		 765 aa  49.3  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5312  hypothetical protein  29.22 
 
 		 625 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  37.27 
 
 		 917 aa  48.5  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  31.06 
 
 		 811 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  39.74 
 
 		 876 aa  48.5  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 		 912 aa  48.1  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.83 
 
 		 970 aa  48.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 		 888 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  29.1 
 
 		 823 aa  47.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  45.65 
 
 		 492 aa  47.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 594 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  27.86 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  33.98 
 
 		 883 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  29.46 
 
 		 904 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  46.15 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  24.54 
 
 		 834 aa  47  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  47.37 
 
 		 750 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  41.67 
 
 		 783 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  29.6 
 
 		 968 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  46.27 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  37.33 
 
 		 888 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  29.71 
 
 		 888 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  40.68 
 
 		 701 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  27.74 
 
 		 914 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  40.68 
 
 		 701 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.54 
 
 		 717 aa  46.2  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  31 
 
 		 794 aa  46.2  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  31.16 
 
 		 904 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  34.86 
 
 		 881 aa  45.8  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 745 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 731 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  34.62 
 
 		 701 aa  45.8  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  34.62 
 
 		 860 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  35.59 
 
 		 943 aa  45.8  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 892 aa  45.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  48.94 
 
 		 858 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.82 
 
 		 921 aa  45.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.4 
 
 		 794 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>