116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0936 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 881 aa  1782    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  47.42 
 
 		 871 aa  708    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  41.93 
 
 		 887 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  41.3 
 
 		 876 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  40.09 
 
 		 868 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  39.95 
 
 		 888 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  42.24 
 
 		 885 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  37.51 
 
 		 857 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.46 
 
 		 897 aa  240  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  31.02 
 
 		 883 aa  233  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  28.76 
 
 		 887 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  29.92 
 
 		 906 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  28.4 
 
 		 887 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  30.98 
 
 		 912 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  30.56 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.08 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  29.37 
 
 		 885 aa  206  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 899 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 		 899 aa  204  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  29.62 
 
 		 912 aa  204  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.51 
 
 		 920 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  29.04 
 
 		 888 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  29.18 
 
 		 888 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  31.09 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  29.38 
 
 		 907 aa  195  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  32.89 
 
 		 701 aa  194  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  29.04 
 
 		 888 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  31.45 
 
 		 915 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.87 
 
 		 892 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  31.61 
 
 		 897 aa  191  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  28.2 
 
 		 899 aa  190  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  33 
 
 		 904 aa  188  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  26.94 
 
 		 948 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  29.42 
 
 		 860 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  34.21 
 
 		 922 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.86 
 
 		 929 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.12 
 
 		 927 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 944 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  28.2 
 
 		 899 aa  180  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 887 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  29.57 
 
 		 854 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.86 
 
 		 971 aa  173  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  28.45 
 
 		 905 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  29.75 
 
 		 854 aa  171  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.95 
 
 		 860 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.12 
 
 		 837 aa  168  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  29.84 
 
 		 901 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  25.29 
 
 		 823 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  27.83 
 
 		 879 aa  162  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.24 
 
 		 885 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.93 
 
 		 970 aa  158  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  30.94 
 
 		 897 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  33 
 
 		 919 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 		 908 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  27 
 
 		 871 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.94 
 
 		 1540 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  31.83 
 
 		 594 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  28.41 
 
 		 965 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  28.05 
 
 		 968 aa  152  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  31.34 
 
 		 918 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  30.17 
 
 		 943 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  31.32 
 
 		 986 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.09 
 
 		 962 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.25 
 
 		 944 aa  125  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  27.85 
 
 		 933 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  33.43 
 
 		 456 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 832 aa  109  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 917 aa  96.3  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.63 
 
 		 750 aa  91.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.14 
 
 		 779 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 		 729 aa  90.9  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  21.24 
 
 		 737 aa  89  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.44 
 
 		 763 aa  88.2  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.85 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.7 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.3 
 
 		 736 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.27 
 
 		 741 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  20.78 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  25.3 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.01 
 
 		 775 aa  75.5  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 781 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  23.82 
 
 		 843 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.09 
 
 		 827 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.05 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 744 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  24.41 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  36.67 
 
 		 804 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  28.09 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.75 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  32.79 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  32.54 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  32.14 
 
 		 1209 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  20.94 
 
 		 807 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  24.69 
 
 		 791 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.1 
 
 		 850 aa  55.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.18 
 
 		 836 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  31.97 
 
 		 566 aa  52  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  27.59 
 
 		 811 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>