204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1639 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 791 aa  1599    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  38.12 
 
 		 795 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  38.24 
 
 		 779 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  37.89 
 
 		 783 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 		 781 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  34.93 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.99 
 
 		 741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  30.21 
 
 		 750 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  29.46 
 
 		 811 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 1027 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  29.6 
 
 		 801 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  31.37 
 
 		 762 aa  194  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.33 
 
 		 737 aa  189  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.07 
 
 		 750 aa  165  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  26.8 
 
 		 744 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  31.81 
 
 		 763 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.18 
 
 		 917 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.56 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  21.68 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 741 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.3 
 
 		 736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  31.76 
 
 		 899 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  27.47 
 
 		 901 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 		 854 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  26.57 
 
 		 883 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  27.07 
 
 		 823 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.39 
 
 		 905 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  30.18 
 
 		 922 aa  103  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.17 
 
 		 885 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  25.76 
 
 		 888 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  25.6 
 
 		 888 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.06 
 
 		 948 aa  101  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.12 
 
 		 921 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  27.41 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  29.24 
 
 		 944 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  25.32 
 
 		 888 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  28.43 
 
 		 919 aa  96.3  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  29.63 
 
 		 912 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  28.67 
 
 		 832 aa  94.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  29.95 
 
 		 892 aa  93.6  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.48 
 
 		 651 aa  93.6  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.97 
 
 		 837 aa  91.3  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  24.34 
 
 		 821 aa  90.1  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  27.76 
 
 		 907 aa  90.1  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  26.99 
 
 		 897 aa  89.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 		 854 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  29.59 
 
 		 899 aa  88.6  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  29.37 
 
 		 906 aa  88.2  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.29 
 
 		 701 aa  87.8  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.11 
 
 		 971 aa  87  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  28.84 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  29.56 
 
 		 912 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.1 
 
 		 827 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  27.76 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  24.59 
 
 		 860 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.01 
 
 		 970 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  22.17 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  21.71 
 
 		 800 aa  85.1  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.35 
 
 		 920 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  26.77 
 
 		 860 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  26.03 
 
 		 915 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  28.76 
 
 		 887 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.95 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  24.82 
 
 		 939 aa  82.4  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.43 
 
 		 1540 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  26.42 
 
 		 908 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  27.77 
 
 		 879 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 881 aa  81.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  25.63 
 
 		 899 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  28.9 
 
 		 904 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 876 aa  81.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  27.15 
 
 		 887 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  26.87 
 
 		 885 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  28.73 
 
 		 857 aa  80.5  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.61 
 
 		 944 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.55 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  26.78 
 
 		 887 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  19.92 
 
 		 778 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  21.76 
 
 		 800 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  28.09 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  27.46 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.74 
 
 		 962 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.58 
 
 		 897 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 801 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  20.56 
 
 		 834 aa  75.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  25.93 
 
 		 594 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  27.06 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  27.55 
 
 		 933 aa  75.1  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  23.1 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  23.1 
 
 		 783 aa  74.3  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.82 
 
 		 892 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 		 899 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  27.51 
 
 		 986 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  27.06 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  21.78 
 
 		 836 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>