141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0826 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 854 aa  1771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  42.04 
 
 		 860 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  39.34 
 
 		 860 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  36.62 
 
 		 837 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  40.37 
 
 		 871 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  39.8 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  32.58 
 
 		 899 aa  313  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.05 
 
 		 885 aa  300  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  33.38 
 
 		 879 aa  298  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.11 
 
 		 905 aa  293  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  32.43 
 
 		 901 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  31.1 
 
 		 887 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  33.84 
 
 		 944 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  32.63 
 
 		 854 aa  283  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.13 
 
 		 971 aa  276  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  32.92 
 
 		 908 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  30.39 
 
 		 929 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.24 
 
 		 927 aa  260  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.32 
 
 		 1540 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  32.37 
 
 		 897 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  29.8 
 
 		 919 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  33.96 
 
 		 883 aa  244  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.92 
 
 		 892 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  33.73 
 
 		 906 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 922 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.96 
 
 		 921 aa  241  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  30.1 
 
 		 965 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  30.37 
 
 		 948 aa  237  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  28.56 
 
 		 888 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  28.56 
 
 		 888 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  31.1 
 
 		 912 aa  235  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  30.62 
 
 		 888 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  31.96 
 
 		 701 aa  231  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 		 899 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  32.95 
 
 		 897 aa  230  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  29.46 
 
 		 904 aa  230  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.18 
 
 		 944 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.5 
 
 		 897 aa  230  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  28.82 
 
 		 892 aa  230  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  30.02 
 
 		 823 aa  229  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  29.72 
 
 		 912 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 832 aa  227  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.55 
 
 		 970 aa  226  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  31.75 
 
 		 887 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  28.27 
 
 		 907 aa  225  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  31.75 
 
 		 887 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.73 
 
 		 962 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  27.72 
 
 		 899 aa  222  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  29.68 
 
 		 918 aa  220  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  27.37 
 
 		 899 aa  219  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  29.63 
 
 		 968 aa  217  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  29.96 
 
 		 933 aa  217  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  27.06 
 
 		 885 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  28.06 
 
 		 915 aa  214  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  28.5 
 
 		 986 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.71 
 
 		 920 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.09 
 
 		 876 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  29.36 
 
 		 908 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  29.06 
 
 		 857 aa  195  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  28.01 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  27.65 
 
 		 943 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  30.34 
 
 		 868 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  27.82 
 
 		 887 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.25 
 
 		 885 aa  178  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  29.57 
 
 		 881 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  27.77 
 
 		 888 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  34.04 
 
 		 456 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 		 729 aa  128  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.36 
 
 		 750 aa  124  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  30.59 
 
 		 795 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.94 
 
 		 741 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  30.35 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.84 
 
 		 737 aa  106  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  26.02 
 
 		 744 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.17 
 
 		 763 aa  104  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 		 1027 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 801 aa  101  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 729 aa  101  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.97 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.48 
 
 		 917 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.5 
 
 		 762 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.38 
 
 		 775 aa  95.1  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.68 
 
 		 764 aa  92.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.95 
 
 		 779 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 783 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.56 
 
 		 736 aa  90.1  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  22.81 
 
 		 726 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2156  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 		 804 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.41 
 
 		 778 aa  75.5  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  25.57 
 
 		 811 aa  74.3  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  30.87 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.8 
 
 		 850 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.2 
 
 		 800 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.46 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  22.62 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  23.67 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>