144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1608 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  43.87 
 
 		 921 aa  793    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 912 aa  1880    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  41.17 
 
 		 906 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  40.53 
 
 		 899 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  41 
 
 		 904 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.01 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  40.21 
 
 		 912 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  40.7 
 
 		 897 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  37.94 
 
 		 907 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  37.19 
 
 		 915 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  37.37 
 
 		 887 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  37.28 
 
 		 887 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  37.19 
 
 		 899 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  38.05 
 
 		 908 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  37.11 
 
 		 899 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  36.66 
 
 		 885 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  39.32 
 
 		 920 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  38.21 
 
 		 892 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  37.1 
 
 		 897 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  41.43 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  34.9 
 
 		 897 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  34.36 
 
 		 883 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  33.12 
 
 		 888 aa  328  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  32.52 
 
 		 888 aa  324  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  32.52 
 
 		 888 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  30.18 
 
 		 823 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  30.79 
 
 		 887 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  30.29 
 
 		 899 aa  276  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  32.32 
 
 		 854 aa  275  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  32.48 
 
 		 944 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  32.25 
 
 		 905 aa  267  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  32.73 
 
 		 868 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  31.74 
 
 		 927 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  30.43 
 
 		 908 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  31.11 
 
 		 929 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  30.65 
 
 		 879 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.87 
 
 		 885 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  41.67 
 
 		 456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  31.1 
 
 		 854 aa  235  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.8 
 
 		 970 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  31.31 
 
 		 948 aa  232  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.04 
 
 		 971 aa  232  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  30.36 
 
 		 965 aa  227  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  31.32 
 
 		 901 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.79 
 
 		 1540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 		 860 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.55 
 
 		 837 aa  213  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  31.13 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  29.21 
 
 		 871 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  30.21 
 
 		 888 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.27 
 
 		 876 aa  211  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  30.98 
 
 		 922 aa  209  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  32.73 
 
 		 887 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.52 
 
 		 860 aa  204  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  29.62 
 
 		 881 aa  204  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  30.88 
 
 		 919 aa  204  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.46 
 
 		 885 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.66 
 
 		 944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  28.85 
 
 		 871 aa  199  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  28.16 
 
 		 933 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  31.38 
 
 		 857 aa  195  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  29.85 
 
 		 986 aa  194  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  27.61 
 
 		 943 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  33.74 
 
 		 918 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  30.14 
 
 		 594 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.76 
 
 		 962 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  32.66 
 
 		 832 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.97 
 
 		 737 aa  134  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  28.18 
 
 		 762 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 781 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.8 
 
 		 750 aa  111  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.39 
 
 		 750 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 779 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 729 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.06 
 
 		 763 aa  106  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  24.88 
 
 		 783 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 		 1027 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  24.92 
 
 		 795 aa  105  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.08 
 
 		 801 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  23.23 
 
 		 741 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.55 
 
 		 917 aa  103  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.52 
 
 		 726 aa  97.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 744 aa  94.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  31.58 
 
 		 811 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  26.03 
 
 		 741 aa  90.9  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  21.74 
 
 		 764 aa  89.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 804 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  22.7 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.67 
 
 		 729 aa  81.3  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  23.96 
 
 		 827 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.36 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.21 
 
 		 736 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  23.18 
 
 		 800 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  25.68 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.9 
 
 		 733 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  29.63 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  21.01 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.22 
 
 		 775 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.39 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  25.18 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>