242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3509 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1726    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.96 
 
 		 799 aa  179  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  29.87 
 
 		 859 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.16 
 
 		 763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.66 
 
 		 492 aa  104  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  25.41 
 
 		 778 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 750 aa  99.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.52 
 
 		 750 aa  98.6  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 744 aa  95.1  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  24.24 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.84 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 741 aa  94  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  30.65 
 
 		 566 aa  93.2  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.93 
 
 		 737 aa  92.4  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 		 729 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  28.45 
 
 		 780 aa  91.3  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.05 
 
 		 726 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  24.61 
 
 		 800 aa  90.5  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  25.44 
 
 		 778 aa  89.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  28.09 
 
 		 779 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  31.74 
 
 		 907 aa  87.4  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  32.45 
 
 		 912 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.77 
 
 		 921 aa  84  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  24.32 
 
 		 834 aa  81.3  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  31.6 
 
 		 901 aa  81.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 772 aa  80.9  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.86 
 
 		 721 aa  80.9  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  20.27 
 
 		 736 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.07 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.36 
 
 		 915 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 		 885 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  29.36 
 
 		 912 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  31.01 
 
 		 899 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.72 
 
 		 917 aa  78.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  41.8 
 
 		 887 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  23.68 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 1078 aa  78.2  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  41.8 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.81 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.5 
 
 		 892 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 		 745 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  21.73 
 
 		 729 aa  77.4  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  24.3 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  21.81 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.77 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.38 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  33.69 
 
 		 899 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.39 
 
 		 821 aa  75.5  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  30.43 
 
 		 906 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 		 905 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  36.79 
 
 		 908 aa  74.7  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  27.34 
 
 		 899 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  29.8 
 
 		 854 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.43 
 
 		 804 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.88 
 
 		 970 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.86 
 
 		 885 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.53 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.91 
 
 		 825 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  26.29 
 
 		 821 aa  72  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  31.56 
 
 		 740 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  29.9 
 
 		 801 aa  72  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.03 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  22.89 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  29.14 
 
 		 892 aa  71.2  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.43 
 
 		 824 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  30.26 
 
 		 871 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 731 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 1027 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  26.2 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.52 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  29.96 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  28.89 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.87 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 879 aa  67.8  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.88 
 
 		 1540 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  24.74 
 
 		 883 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  28.52 
 
 		 871 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  26.55 
 
 		 832 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 		 651 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  36.84 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.15 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 904 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  27.89 
 
 		 887 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  35.79 
 
 		 948 aa  64.7  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  28 
 
 		 899 aa  64.7  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.63 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  24.56 
 
 		 888 aa  64.3  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 912 aa  63.9  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  24.56 
 
 		 888 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 811 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  23.65 
 
 		 908 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  30.55 
 
 		 904 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>