117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0778 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
888 aa  1743    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  49.61 
 
 
868 aa  693    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  80.18 
 
 
887 aa  1367    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  39.86 
 
 
871 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  39.95 
 
 
881 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  41.85 
 
 
876 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  40.54 
 
 
885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  40.48 
 
 
857 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  28.9 
 
 
921 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  30.83 
 
 
912 aa  235  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.2 
 
 
892 aa  234  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  30.58 
 
 
907 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  30.46 
 
 
883 aa  231  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.12 
 
 
920 aa  227  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  30.64 
 
 
887 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  30.55 
 
 
887 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 
912 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  33.46 
 
 
897 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.21 
 
 
897 aa  221  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  28.86 
 
 
908 aa  220  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  29.84 
 
 
915 aa  220  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  28.61 
 
 
885 aa  219  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  28.73 
 
 
899 aa  218  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  28.8 
 
 
888 aa  218  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  28.8 
 
 
888 aa  217  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  31.14 
 
 
892 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  30.05 
 
 
888 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  31.15 
 
 
904 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 
899 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  27.35 
 
 
899 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  35.44 
 
 
701 aa  211  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  30.38 
 
 
906 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  26.75 
 
 
823 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  30.08 
 
 
854 aa  197  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  32.02 
 
 
899 aa  193  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  29.46 
 
 
879 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  31.26 
 
 
860 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  27.77 
 
 
854 aa  187  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.15 
 
 
905 aa  185  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  29.2 
 
 
860 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  33.87 
 
 
922 aa  183  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.43 
 
 
927 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  30.1 
 
 
944 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 
908 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  26.24 
 
 
948 aa  178  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  27.28 
 
 
887 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.79 
 
 
970 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.57 
 
 
885 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.86 
 
 
971 aa  168  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  31.24 
 
 
965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.78 
 
 
837 aa  164  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.92 
 
 
929 aa  162  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  30.43 
 
 
901 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  31.5 
 
 
943 aa  162  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 
871 aa  156  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  29.35 
 
 
594 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.09 
 
 
1540 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  30.17 
 
 
968 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  29.75 
 
 
986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  29.04 
 
 
933 aa  148  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  29.85 
 
 
919 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  31.57 
 
 
918 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.49 
 
 
944 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  26.09 
 
 
832 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.03 
 
 
962 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  31.64 
 
 
456 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.84 
 
 
763 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  29.74 
 
 
917 aa  99.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
729 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.91 
 
 
799 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.6 
 
 
737 aa  82.8  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.86 
 
 
775 aa  82.8  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.67 
 
 
726 aa  82  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.33 
 
 
750 aa  81.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.72 
 
 
750 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.97 
 
 
744 aa  74.7  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  29.81 
 
 
779 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.28 
 
 
783 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.04 
 
 
736 aa  72  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
781 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.12 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.06 
 
 
764 aa  68.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.53 
 
 
741 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 
566 aa  65.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  34.78 
 
 
780 aa  65.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.68 
 
 
729 aa  65.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  22.45 
 
 
741 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
1027 aa  63.9  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.64 
 
 
791 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  35.48 
 
 
828 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.98 
 
 
827 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 
778 aa  60.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  27.02 
 
 
850 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  26.98 
 
 
859 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  37.04 
 
 
1209 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  22.07 
 
 
843 aa  58.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.36 
 
 
801 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 
795 aa  55.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  28.97 
 
 
873 aa  55.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  31.12 
 
 
804 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>