197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2299 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 750 aa  1546    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  33.01 
 
 		 762 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 729 aa  220  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.23 
 
 		 741 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  26.5 
 
 		 750 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  35.48 
 
 		 737 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  28.22 
 
 		 741 aa  188  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 726 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.44 
 
 		 783 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.32 
 
 		 763 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  24.49 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 781 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.03 
 
 		 804 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.77 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 764 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  25.54 
 
 		 795 aa  151  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  26.7 
 
 		 744 aa  147  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.15 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.9 
 
 		 775 aa  144  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  31.59 
 
 		 888 aa  144  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  31.23 
 
 		 888 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 917 aa  141  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  30.77 
 
 		 888 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 		 1027 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  31.78 
 
 		 823 aa  137  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.76 
 
 		 885 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.12 
 
 		 837 aa  131  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  29.97 
 
 		 899 aa  131  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  29.89 
 
 		 905 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  31.43 
 
 		 921 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 906 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  27.54 
 
 		 904 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  26.29 
 
 		 791 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.24 
 
 		 929 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  24.36 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  29.28 
 
 		 907 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  29.35 
 
 		 899 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.18 
 
 		 970 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  29.51 
 
 		 883 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  27.22 
 
 		 887 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.02 
 
 		 892 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  27.31 
 
 		 901 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.35 
 
 		 854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 897 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  25.84 
 
 		 832 aa  119  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  28.37 
 
 		 885 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  24.92 
 
 		 927 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 915 aa  117  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  23.26 
 
 		 919 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  26.8 
 
 		 912 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 		 811 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 899 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  28.1 
 
 		 899 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  23.76 
 
 		 860 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  26.42 
 
 		 892 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  23.48 
 
 		 944 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  27.62 
 
 		 887 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  25.98 
 
 		 701 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.44 
 
 		 801 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  27.35 
 
 		 887 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  25.94 
 
 		 594 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  24.41 
 
 		 800 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  25.53 
 
 		 908 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  27.37 
 
 		 854 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  26.17 
 
 		 912 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  25.86 
 
 		 651 aa  108  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  26.23 
 
 		 908 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.27 
 
 		 897 aa  108  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  26.48 
 
 		 871 aa  108  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  26.61 
 
 		 860 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.47 
 
 		 920 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  25.52 
 
 		 965 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 948 aa  104  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  26.28 
 
 		 850 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.08 
 
 		 971 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  25.91 
 
 		 897 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 		 879 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 776 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 829 aa  99  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 		 799 aa  98.6  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.11 
 
 		 962 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  23.7 
 
 		 922 aa  97.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.75 
 
 		 1540 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.42 
 
 		 751 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.09 
 
 		 836 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  23.57 
 
 		 881 aa  95.5  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  22.96 
 
 		 933 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 784 aa  95.5  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 		 820 aa  94.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.96 
 
 		 566 aa  94.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 778 aa  94.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  25.96 
 
 		 968 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26.28 
 
 		 721 aa  94  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  25.23 
 
 		 783 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.75 
 
 		 492 aa  93.2  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 827 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.95 
 
 		 876 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  26.21 
 
 		 765 aa  89.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.63 
 
 		 733 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  20.88 
 
 		 885 aa  89  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>