145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5524 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 827 aa  1711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.34 
 
 		 737 aa  118  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 729 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 750 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.67 
 
 		 763 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 		 778 aa  101  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.65 
 
 		 970 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 701 aa  94.7  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  27.81 
 
 		 892 aa  94.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.69 
 
 		 783 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  27.29 
 
 		 823 aa  92  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  26.18 
 
 		 860 aa  92  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28 
 
 		 741 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 		 929 aa  91.3  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  22.83 
 
 		 762 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.72 
 
 		 750 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.4 
 
 		 971 aa  89  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  26.25 
 
 		 908 aa  89  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.57 
 
 		 1540 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 879 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 		 944 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.08 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  29.15 
 
 		 901 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  25.12 
 
 		 943 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 907 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.85 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  27.1 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.53 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  25.6 
 
 		 922 aa  84.3  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  25.46 
 
 		 968 aa  84.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  26.4 
 
 		 899 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  27.93 
 
 		 915 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 908 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.92 
 
 		 781 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  26.59 
 
 		 883 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.14 
 
 		 885 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 779 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 		 965 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  25.67 
 
 		 887 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 854 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.09 
 
 		 892 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  25.67 
 
 		 887 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 		 741 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.86 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  24.83 
 
 		 1027 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.78 
 
 		 837 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.21 
 
 		 744 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  28.29 
 
 		 899 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.85 
 
 		 795 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.26 
 
 		 764 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  23.96 
 
 		 912 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  25.8 
 
 		 887 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 919 aa  76.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.18 
 
 		 944 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.53 
 
 		 736 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 871 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  27 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 912 aa  74.3  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.69 
 
 		 948 aa  74.3  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 780 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  24.73 
 
 		 927 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  21.66 
 
 		 804 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  26.39 
 
 		 888 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  27.63 
 
 		 904 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  26.97 
 
 		 871 aa  73.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  21.53 
 
 		 834 aa  72.8  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.68 
 
 		 729 aa  72  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  27.36 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  27.48 
 
 		 854 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  30.92 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  27 
 
 		 888 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  26.57 
 
 		 807 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  26.06 
 
 		 899 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 885 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.78 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22.73 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  24.79 
 
 		 811 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  27.11 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 933 aa  68.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  29.46 
 
 		 899 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  21.24 
 
 		 800 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  21.51 
 
 		 765 aa  67  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  25.41 
 
 		 843 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.4 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  22.57 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  25.4 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.48 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  23.56 
 
 		 832 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  30.71 
 
 		 873 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  40 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  21.5 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.34 
 
 		 850 aa  62  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.01 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  23.06 
 
 		 857 aa  61.6  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>