206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1134 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
566 aa  1133    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  30.38 
 
 
566 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.39 
 
 
492 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.73 
 
 
488 aa  100  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.21 
 
 
799 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.41 
 
 
762 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  24.57 
 
 
548 aa  88.6  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.25 
 
 
741 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 
729 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  26.02 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  21.08 
 
 
737 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.26 
 
 
763 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 
484 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  30.92 
 
 
827 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 
804 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 
780 aa  70.5  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  29.48 
 
 
491 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  24.8 
 
 
836 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  27.04 
 
 
828 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  26.35 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
1027 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.33 
 
 
736 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.85 
 
 
779 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
781 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.09 
 
 
724 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  25.28 
 
 
663 aa  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  27.8 
 
 
850 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.86 
 
 
675 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 
795 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.82 
 
 
820 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.56 
 
 
721 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  25.32 
 
 
859 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  23.01 
 
 
765 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.94 
 
 
729 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.64 
 
 
744 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  28.74 
 
 
948 aa  58.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.68 
 
 
726 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  21.01 
 
 
764 aa  58.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.64 
 
 
811 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.85 
 
 
733 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 
922 aa  57  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 
777 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  28.91 
 
 
873 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.49 
 
 
775 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.96 
 
 
783 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  22.13 
 
 
651 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.52 
 
 
890 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  32.43 
 
 
843 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  24.6 
 
 
871 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  28.14 
 
 
750 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  25.41 
 
 
898 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.1 
 
 
756 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  35.19 
 
 
905 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.93 
 
 
916 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.25 
 
 
744 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  21.81 
 
 
914 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  31.36 
 
 
944 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
931 aa  53.9  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.78 
 
 
602 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81007  predicted protein  23.17 
 
 
558 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.661709  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  21.61 
 
 
783 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.52 
 
 
717 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  22.97 
 
 
823 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.85 
 
 
905 aa  52.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  34.95 
 
 
899 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  24.01 
 
 
883 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.56 
 
 
591 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  32.23 
 
 
933 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.64 
 
 
776 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  21.38 
 
 
822 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 
732 aa  51.2  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  23.5 
 
 
917 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  21.14 
 
 
800 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  24.29 
 
 
644 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  31.85 
 
 
887 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18199  predicted protein  26.32 
 
 
595 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  26.25 
 
 
907 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  31.85 
 
 
887 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1049  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.82 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.397749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  24.51 
 
 
781 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.43 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.21 
 
 
801 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.81 
 
 
967 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.8 
 
 
860 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.73 
 
 
1540 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03650  ATP dependent RNA helicase, putative  28 
 
 
620 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 
722 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.55 
 
 
592 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  25.56 
 
 
854 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  21.28 
 
 
800 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.2 
 
 
926 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001506  ATP-dependent RNA helicase  25.36 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000291883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  30.63 
 
 
904 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  22.42 
 
 
595 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.24 
 
 
458 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.09 
 
 
751 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05443  ATP-dependent RNA helicase  24.78 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  29.63 
 
 
899 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.58 
 
 
885 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>